Descripteur
Termes IGN > sciences naturelles > sciences de la vie > biologie > botanique
botaniqueSynonyme(s)biologie végétale phytologie |
Documents disponibles dans cette catégorie (1198)
Ajouter le résultat dans votre panier
Visionner les documents numériques
Affiner la recherche Interroger des sources externes
Etendre la recherche sur niveau(x) vers le bas
CAVIAR: an R package for checking, displaying and processing wood-formation-monitoring data / Cyrille B.K. Rathgeber in Tree Physiology, vol 38 n° 8 (August 2018)
[article]
Titre : CAVIAR: an R package for checking, displaying and processing wood-formation-monitoring data Type de document : Article/Communication Auteurs : Cyrille B.K. Rathgeber, Auteur ; Philippe Santenoise, Auteur ; Henri E. Cuny , Auteur Année de publication : 2018 Projets : ARBRE / AgroParisTech (2007 -) Article en page(s) : pp 1246 - 1260 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] cerne
[Termes IGN] données allométriques
[Termes IGN] dynamique de la végétation
[Termes IGN] forêt boréale
[Termes IGN] forêt tempérée
[Termes IGN] inventaire forestier (techniques et méthodes)
[Termes IGN] Loi de Gompertz
[Termes IGN] phénologie
[Termes IGN] Pinophyta
[Termes IGN] R (langage)
[Termes IGN] régression logistique
[Termes IGN] visualisation de données
[Vedettes matières IGN] Inventaire forestierRésumé : (auteur) In the last decade, the pervasive question of climate change impacts on forests has revived investigations on intra-annual dynamics of wood formation, involving disciplines such as plant ecology, tree physiology and dendrochronology. This resulted in the creation of many research groups working on this topic worldwide and a rapid increase in the number of studies and publications. Wood-formation-monitoring studies are generally based on a common conceptual model describing xylem cell formation as the succession of four differentiation phases (cell division, cell enlargement, cell wall thickening and mature cells). They generally use the same sampling techniques, sample preparation methods and anatomical criteria to separate between differentiation zones and discriminate and count forming xylem cells, resulting in very similar raw data. However, the way these raw data are then processed, producing the elaborated data on which statistical analyses are performed, still remains quite specific to each individual study. Thereby, despite very similar raw data, wood-formation-monitoring studies yield results that are still quite difficult to compare. CAVIAR—an R package specifically dedicated to the verification, visualization and manipulation of wood-formation-monitoring data—can help to improve this situation. Initially, CAVIAR was built to provide efficient algorithms to compute critical dates of wood formation phenology for conifers growing in temperate and cold environments. Recently, we developed it further to check, display and process wood-formation-monitoring data. Thanks to new and upgraded functions, raw data can now be consistently verified, standardized and modelled (using logistic regressions and Gompertz functions), in order to describe wood phenology and intra-annual dynamics of tree-ring formation. We believe that CAVIAR will help strengthening the science of wood formation dynamics by effectively contributing to the standardization of its concepts and methods, making thereby possible the comparison between data and results from different studies. Numéro de notice : A2018-657 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2012-2019) Thématique : FORET Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1093/treephys/tpy054 Date de publication en ligne : 19/05/2018 En ligne : https://doi.org/10.1093/treephys/tpy054 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=93813
in Tree Physiology > vol 38 n° 8 (August 2018) . - pp 1246 - 1260[article]Comparison of high-density LiDAR and satellite photogrammetry for forest inventory / Grant D. Pearse in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 142 (August 2018)
[article]
Titre : Comparison of high-density LiDAR and satellite photogrammetry for forest inventory Type de document : Article/Communication Auteurs : Grant D. Pearse, Auteur ; Jonathan P. Dash, Auteur ; Henrik J. Persson, Auteur ; Michael S. Watt, Auteur Année de publication : 2018 Article en page(s) : pp 257 - 267 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] densité de la végétation
[Termes IGN] données lidar
[Termes IGN] données localisées 3D
[Termes IGN] forêt
[Termes IGN] hauteur des arbres
[Termes IGN] image multibande
[Termes IGN] image Pléiades-HR
[Termes IGN] inventaire forestier (techniques et méthodes)
[Termes IGN] modèle numérique de surface de la canopée
[Termes IGN] Nouvelle-Zélande
[Termes IGN] photogrammétrie numérique
[Termes IGN] Pinus radiata
[Termes IGN] semis de points
[Termes IGN] surface terrière
[Termes IGN] sylviculture
[Termes IGN] volume en bois
[Vedettes matières IGN] Inventaire forestierRésumé : (Auteur) Point cloud data derived from stereo satellite imagery has the potential to provide large-scale forest inventory assessment but these methods are known to include higher error than airborne laser scanning (ALS). This study compares the accuracy of forest inventory attributes estimated from high-density ALS (21.1 pulses m−2) point cloud data (PCD) and PCD derived from photogrammetric methods applied to stereo satellite imagery obtained over a Pinus radiata D. Don plantation forest in New Zealand. The statistical and textural properties of the canopy height models (CHMs) derived from each point cloud were included alongside standard PCD metrics as a means of improving the accuracy of predictions for key forest inventory attributes. For mean top height (a measure of dominant height in a stand), ALS data produced better estimates (R2 = 0.88; RMSE = 1.7 m) than those obtained from satellite data (R2 = 0.81; RMSE = 2.1 m). This was attributable to a general over-estimation of canopy heights in the satellite PCD. ALS models produced poor estimates of stand density (R2 = 0.48; RMSE = 112.1 stems ha−1), as did the satellite PCD models (R2 = 0.42; RMSE = 118.4 stems ha−1). ALS models produced accurate estimates of basal area (R2 = 0.58; RMSE = 12 m2 ha−1), total stem volume (R2 = 0.72; RMSE = 107.5 m3 ha−1), and total recoverable volume (R2 = 0.74; RMSE = 92.9 m3 ha−1). These values differed little from the estimates of basal area (R2 = 0.57; RMSE = 12.2 m2 ha−1), total stem volume (R2 = 0.70; RMSE = 112.6 m3 ha−1), and total recoverable volume (R2 = 0.73; RMSE = 96 m3 ha−1) obtained from satellite PCD models. The statistical and textural metrics computed from the CHMs were important variables in all of the models derived from both satellite and ALS PCD, nearly always outranking the standard PCD metrics in measures of importance. For the satellite PCD models, the CHM-derived metrics were nearly exclusively identified as important variables. These results clearly show that point cloud data obtained from stereo satellite imagery are useful for prediction of forest inventory attributes in intensively managed forests on steeper terrain. Furthermore, these data offer forest managers the benefit of obtaining both inventory data and high-resolution multispectral imagery from a single product. Numéro de notice : A2018-295 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1016/j.isprsjprs.2018.06.006 Date de publication en ligne : 22/06/2018 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.isprsjprs.2018.06.006 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=90413
in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing > vol 142 (August 2018) . - pp 257 - 267[article]Réservation
Réserver ce documentExemplaires(3)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 081-2018081 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible 081-2018083 DEP-EXM Revue LASTIG Dépôt en unité Exclu du prêt 081-2018082 DEP-EAF Revue Nancy Dépôt en unité Exclu du prêt Detecting newly grown tree leaves from unmanned-aerial-vehicle images using hyperspectral target detection techniques / Chinsu Lin in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 142 (August 2018)
[article]
Titre : Detecting newly grown tree leaves from unmanned-aerial-vehicle images using hyperspectral target detection techniques Type de document : Article/Communication Auteurs : Chinsu Lin, Auteur ; Shih-Yu Chen, Auteur ; Chia-Chun Chen, Auteur ; Chia-Huei Tai, Auteur Année de publication : 2018 Article en page(s) : pp 174 - 189 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] analyse d'image orientée objet
[Termes IGN] changement climatique
[Termes IGN] croissance des arbres
[Termes IGN] drone
[Termes IGN] feuille (végétation)
[Termes IGN] image aérienne
[Termes IGN] image hyperspectrale
[Termes IGN] image RVB
[Termes IGN] indice de végétation
[Termes IGN] Kappa de Cohen
[Termes IGN] Taïwan
[Vedettes matières IGN] Végétation et changement climatiqueRésumé : (auteur) Phenological events of tree leaves from initiation to senescence is generally influenced by temperature and water availability. Detection of newly grown leaves (NGL) is useful in the diagnosis of growth of trees, tree stress and even climatic change. Utilizing very high resolution UAV images, this paper examines the feasibility of NGL detection using hyperspectral detection algorithms and anomaly detectors. The issues of pixel resolution and hard decision thresholding in deriving accurate NGL maps are also explored. Results showed that the blind-detection algorithms RXDs are not suitable for NGL detection due to the spectra similarity between NGL and both mature leaves and grass, while brighter pixels, such as those produced by soil and concrete materials, are more easily recognized as anomaly in contrast to forest. Matching filter (MF) based detectors are, however, able to accurately detect NGL over forest stands and are even more effective in the sense of achieving satisfactory true positives and true negatives while providing minimal false alarms. Of the tested partial knowledge MF algorithms, the covariance matched filter based distance (KMFD) detector performed very well with overall accuracy (OA) 0.97 and kappa coefficient () 0.60 on a natural resolution of 6.75 cm image. When a variety of mature-leaf nonobjective targets are included in the detection, the orthogonal subspace projector (OSP) tends to suppress NGL pixels as an unwanted signature and this leads to poor detection. Conversely, the target constrained interference minimized filter (TCIMF) detector is still able to effectively detect NGL with a satisfactory OA and through effective matching filter of the target signature as the hard-decision threshold is subject to a level of 5% or 1% probability of false alarms. From decimeter resolution satellite images, the KMFD and TCIMF detectors are capable of achieving an accuracy of OA = 0.94 and = 0.56 or OA = 0.87 and = 0.48 for images with a resolution of 33.75 cm or 67.50 cm respectively. This indicates that hyperspectral target detection techniques have great potential in NGL detection via high spatial resolution satellite multispectral images. Numéro de notice : A2018-294 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1016/j.isprsjprs.2018.05.022 Date de publication en ligne : 15/06/2018 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.isprsjprs.2018.05.022 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=90412
in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing > vol 142 (August 2018) . - pp 174 - 189[article]Réservation
Réserver ce documentExemplaires(3)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 081-2018081 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible 081-2018083 DEP-EXM Revue LASTIG Dépôt en unité Exclu du prêt 081-2018082 DEP-EAF Revue Nancy Dépôt en unité Exclu du prêt Digital aerial photogrammetry for assessing cumulative spruce budworm defoliation and enhancing forest inventories at a landscape-level / Tristan R.H. Goodbody in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 142 (August 2018)
[article]
Titre : Digital aerial photogrammetry for assessing cumulative spruce budworm defoliation and enhancing forest inventories at a landscape-level Type de document : Article/Communication Auteurs : Tristan R.H. Goodbody, Auteur ; Nicholas C. Coops, Auteur ; Txomin Hermosilla, Auteur ; Piotr Tompalski, Auteur ; Grant MacCartney, Auteur ; David A. MacLean, Auteur Année de publication : 2018 Article en page(s) : pp 1 - 11 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] défoliation
[Termes IGN] dégradation de la flore
[Termes IGN] échantillonnage d'image
[Termes IGN] insecte nuisible
[Termes IGN] inventaire forestier (techniques et méthodes)
[Termes IGN] méthode des moindres carrés
[Termes IGN] Ontario (Canada)
[Termes IGN] photogrammétrie aérienne
[Termes IGN] photogrammétrie numérique
[Termes IGN] Picea abies
[Termes IGN] régression linéaire
[Termes IGN] semis de points
[Termes IGN] surface terrière
[Termes IGN] surveillance forestière
[Vedettes matières IGN] Inventaire forestierRésumé : (Auteur) Spruce budworm (Choristoneura fumiferana [Clem.], Lepidoptera: Tortricidae) is a native defoliating insect with an important disturbance role in the eastern boreal forests of North America. With an extensive history of outbreaks and associated impacts on forest structural changes and timber supply, the mapping of spruce budworm defoliation has been of major management importance. In this study we assessed the ability of high spatial resolution digital aerial photogrammetric (DAP) data to predict cumulative defoliation as well as basal area and merchantable volume in spruce budworm host stands in the Gordon Cosens Forest south of Kapuskasing, Ontario, Canada. To do so, DAP derived structural and spectral metrics were incorporated to implement a stratified sampling design to improve the efficiency and cost-effectiveness of field surveying. Standard forest inventory measurements including diameter and height, as well as ocular and branch level defoliation assessments were undertaken on thirty 400 m2 radius plots. A partial least squares analysis was performed to determine whether structural metrics from a DAP point cloud could be influenced by spruce budworm defoliation, as well as determine the relative effectiveness of spectral (e.g. mean NDVI) vs. structural (e.g. 90th percentile of height) metrics, or their combination, for predicting cumulative defoliation. Results indicated that spectral metrics were the most effective for predicting cumulative defoliation (R2 = 0.79), while structural metrics were the least effective (R2 = 0.49). Metrics characterizing variance of the spectral values were found to be the most important predictors. Structural metrics and linear regression were also used to estimate landscape-level volume and basal area per hectare yielding R2 = 0.80 and R2 = 0.90, respectively. Outcomes of this analysis indicate that DAP-derived spectral metrics were more capable of modeling cumulative defoliation, while structural metrics were effective for landscape-level estimations of standard forest inventory attributes. This analysis indicated that the provision of both spectral and structural metrics from a single aerial imagery survey has potential to enhance defoliation monitoring and forest attribute modeling at a landscape-level. Numéro de notice : A2018-290 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1016/j.isprsjprs.2018.05.012 Date de publication en ligne : 01/08/2018 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.isprsjprs.2018.05.012 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=90408
in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing > vol 142 (August 2018) . - pp 1 - 11[article]Réservation
Réserver ce documentExemplaires(3)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 081-2018081 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible 081-2018083 DEP-EXM Revue LASTIG Dépôt en unité Exclu du prêt 081-2018082 DEP-EAF Revue Nancy Dépôt en unité Exclu du prêt Est-il possible de tirer des enseignements des introductions anciennes d'agents pathogènes ? L'exemple de la graphiose de l'orme / Dominique Piou in Revue forestière française, vol 70 n° 6 (2018)
[article]
Titre : Est-il possible de tirer des enseignements des introductions anciennes d'agents pathogènes ? L'exemple de la graphiose de l'orme Titre original : Are There Any Lessons to be Learnt from Long-standing Introductions of Pathogens? The Case of Dutch Elm disease Type de document : Article/Communication Auteurs : Dominique Piou, Auteur ; Fabienne Benest , Auteur ; Eric Collin, Auteur Année de publication : 2018 Projets : 1-Pas de projet / AgroParisTech (2007 -) Article en page(s) : pp 621 - 637 Note générale : bibliographie Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Végétation
[Termes IGN] inventaire forestier national (données France)
[Termes IGN] maladie cryptogamique
[Termes IGN] maladie phytosanitaire
[Termes IGN] santé des forêts
[Termes IGN] Scolytinae
[Termes IGN] Ulmus glabra
[Termes IGN] Ulmus minorRésumé : (auteur) La graphiose ou maladie hollandaise de l'orme a été détectée il y a près de cent ans dans le nord-est de la France. Depuis, elle s'est largement répandue au point d'être considérée comme une des maladies les plus destructives jamais observée sur ligneux, aussi bien en Europe qu'en Amérique du nord. D'autres maladies se sont révélées tout aussi dévastatrices comme le chancre du châtaignier, la aussi en Europe et Amérique du nord, ou potentiellement tout aussi dommageables comme la chalarose du frêne en Europe. Il était des lors intéressant d'essayer de tirer quelques enseignements d'une des plus anciennes pandémies affectant une essence forestière. En réalité, ce sont deux pandémies successives de graphiose, attribuées a deux champignons distincts (Ophiostoma ulmi puis O. novo-ulmi) qui se sont développées en Europe. O. novo-ulmi, responsable depuis la fin des années 1960 de la pandémie la plus grave, a connu au cours de son extension des changements évolutifs rapides par hybridation et transfert horizontal de gènes avec d'autres espèces. L'agressivité de ce champignon ne semble pas avoir diminué depuis cinquante ans et le volume d'Orme sur pied dans les forets françaises a fortement régressé, mais semble se stabiliser depuis une dizaine d'années entre 2 et 4 millions de mètres cubes, avec une dominance de jeunes tiges, selon les données de l'Inventaire forestier national. La mortalité en forêt semble également relativement faible, peut-être en liaison avec une chute des populations de son principal vecteur (Scolytus scolytus) qui est principalement inféodé aux arbres adultes. Malgré la diminution drastique des effectifs d'Orme, aucune étude n'a mis en évidence une diminution de la diversité génétique des populations champêtres en Europe. Par contre, l'introduction d'une espèce d'Orme asiatique résistante à la graphiose dans le sud de l'Europe a conduit après hybridation et introgression à des modifications irréversibles de la structure génétique des ormes autochtones. Dans cette zone, les actions de l'homme suite à la maladie pourraient avoir plus fortement modifié la structure génétique des populations d'Orme que la maladie elle-même. De même, les effets des deux pandémies successives sur la biodiversité associée aux ormes semblent relativement limités d'après la littérature. Ces résultats ne sont pas conformes à la vision alarmiste qui régnait au début des années 1980, laquelle avait entrainé la mise en place d'un conservatoire de ressources génétiques d'Orme sous la forme d'un parc à clones et suscite l'espoir de sélectionner des ormes résistants. Aucun clone ne s'est montré fortement résistant à la graphiose mais certains, parmi les plus aptes à guérir, peuvent contribuer à la reconstitution de haies champêtres. Dans les années 1990, des unités de conservation in situ, pour des populations d'Orme lisse et d'Orme de montagne ont pu être installées dans le cadre d'un réseau coordonné au niveau européen. Numéro de notice : A2018-678 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2012-2019) Thématique : FORET Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueNat DOI : 10.4267/2042/70312 En ligne : https://doi.org/10.4267/2042/70312 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96408
in Revue forestière française > vol 70 n° 6 (2018) . - pp 621 - 637[article]Estimating storm damage with the help of low-altitude photographs and different sampling designs and estimators / Pekka Hyvönen in Silva fennica, vol 52 n° 3 ([01/08/2018])PermalinkA generic remote sensing approach to derive operational essential biodiversity variables (EBVs) for conservation planning / Samuel Alleaume in Methods in ecology and evolution, vol 9 n° 8 (August 2018)PermalinkICARE-VEG: A 3D physics-based atmospheric correction method for tree shadows in urban areas / Karine R.M. Adeline in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 142 (August 2018)PermalinkIncorporating crown shape information for identifying ash tree species / Haijian Liu in Photogrammetric Engineering & Remote Sensing, PERS, vol 84 n° 8 (août 2018)PermalinkIncorporating tree- and stand-level information on crown base height into multivariate forest management inventories based on airborne laser scanning / Matti Maltamo in Silva fennica, vol 52 n° 3 ([01/08/2018])PermalinkIntra-annual phenology for detecting understory plant invasion in urban forests / Kunwar K. Singh in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 142 (August 2018)PermalinkMonitoring climate sensitivity shifts in tree-rings of Eastern Boreal North America using model-data comparison : Shifts in tree growth sensivity to climate / Clémentine Ols in Ecosystems, vol 21 n° 5 (August 2018)PermalinkAdaptive stopping criterion for top-down segmentation of ALS point clouds in temperate coniferous forests / Nina Amiri in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 141 (July 2018)PermalinkEvolutionary approach for detection of buried remains using hyperspectral images / Leon Dozal in Photogrammetric Engineering & Remote Sensing, PERS, vol 84 n° 7 (juillet 2018)PermalinkExtracting leaf area index using viewing geometry effects : A new perspective on high-resolution unmanned aerial system photography / Lukas Roth in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 141 (July 2018)PermalinkMulti-scale assessment of invasive plant species diversity using Pléiades 1A, RapidEye and Landsat-8 data / Siddhartha Khare in Geocarto international, vol 33 n° 7 (July 2018)PermalinkParametric bootstrap estimators for hybrid inference in forest inventories / Mathieu Fortin in Forestry, an international journal of forest research, vol 91 n° 3 (July 2018)PermalinkPredicting hardwood quality and its evolution over time in Quebec's forests / Hughes Power in Forestry, an international journal of forest research, vol 91 n° 3 (July 2018)PermalinkAssessment of Sentinel-1A data for rice crop classification using random forests and support vector machines / Nguyen-Thanh Son in Geocarto international, vol 33 n° 6 (June 2018)PermalinkData collection methods for forest inventory: a comparison between an integrated conventional equipment and terrestrial laser scanning / Bogdan Apostol in Annals of forest research, vol 61 n° 2 (July - December 2018)PermalinkEU priority habitats: rethinking Mediterranean coastal pine forests / Gianmaria Bonari in Rendiconti Lincei. Scienze Fisiche e Naturali, vol 29 n° 2 (June 2018)PermalinkGIS Coop: networks of silvicultural trials for supporting forest management under changing environment / Ingrid Seynave in Annals of Forest Science, vol 75 n° 2 (June 2018)PermalinkHow does economic research contribute to the management of forest ecosystem services? / Serge Garcia in Annals of Forest Science, vol 75 n° 2 (June 2018)PermalinkInference on forest attributes and ecological diversity of trees outside forest by a two-phase inventory / Marco Marchetti in Annals of Forest Science, vol 75 n° 2 (June 2018)PermalinkLive fuel moisture content (LFMC) time series for multiple sites and species in the French Mediterranean area since 1996 / N. Martin-St Paul in Annals of Forest Science, vol 75 n° 2 (June 2018)Permalink