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Transfer learning from citizen science photographs enables plant species identification in UAV imagery / Salim Soltani in ISPRS Open Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, vol 5 (August 2022)
[article]
Titre : Transfer learning from citizen science photographs enables plant species identification in UAV imagery Type de document : Article/Communication Auteurs : Salim Soltani, Auteur ; Hannes Feilhauer, Auteur ; Robbert Duker, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2022 Article en page(s) : n° 100016 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Traitement d'image optique
[Termes IGN] apprentissage profond
[Termes IGN] base de données naturalistes
[Termes IGN] classification par réseau neuronal convolutif
[Termes IGN] distribution spatiale
[Termes IGN] données localisées des bénévoles
[Termes IGN] espèce végétale
[Termes IGN] filtrage de la végétation
[Termes IGN] identification de plantes
[Termes IGN] image captée par drone
[Termes IGN] orthoimage couleur
[Termes IGN] science citoyenne
[Termes IGN] segmentation sémantiqueRésumé : (auteur) Accurate information on the spatial distribution of plant species and communities is in high demand for various fields of application, such as nature conservation, forestry, and agriculture. A series of studies has shown that Convolutional Neural Networks (CNNs) accurately predict plant species and communities in high-resolution remote sensing data, in particular with data at the centimeter scale acquired with Unoccupied Aerial Vehicles (UAV). However, such tasks often require ample training data, which is commonly generated in the field via geocoded in-situ observations or labeling remote sensing data through visual interpretation. Both approaches are laborious and can present a critical bottleneck for CNN applications. An alternative source of training data is given by using knowledge on the appearance of plants in the form of plant photographs from citizen science projects such as the iNaturalist database. Such crowd-sourced plant photographs typically exhibit very different perspectives and great heterogeneity in various aspects, yet the sheer volume of data could reveal great potential for application to bird’s eye views from remote sensing platforms. Here, we explore the potential of transfer learning from such a crowd-sourced data treasure to the remote sensing context. Therefore, we investigate firstly, if we can use crowd-sourced plant photographs for CNN training and subsequent mapping of plant species in high-resolution remote sensing imagery. Secondly, we test if the predictive performance can be increased by a priori selecting photographs that share a more similar perspective to the remote sensing data. We used two case studies to test our proposed approach with multiple RGB orthoimages acquired from UAV with the target plant species Fallopia japonica and Portulacaria afra respectively. Our results demonstrate that CNN models trained with heterogeneous, crowd-sourced plant photographs can indeed predict the target species in UAV orthoimages with surprising accuracy. Filtering the crowd-sourced photographs used for training by acquisition properties increased the predictive performance. This study demonstrates that citizen science data can effectively anticipate a common bottleneck for vegetation assessments and provides an example on how we can effectively harness the ever-increasing availability of crowd-sourced and big data for remote sensing applications. Numéro de notice : A2022-488 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article DOI : 10.1016/j.ophoto.2022.100016 Date de publication en ligne : 23/05/2022 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.ophoto.2022.100016 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=100956
in ISPRS Open Journal of Photogrammetry and Remote Sensing > vol 5 (August 2022) . - n° 100016[article]
Titre : L'îlot Kergaher, un lieu nature pour toutes et tous Type de document : Mémoire Auteurs : Raphaël Mattioni, Auteur Editeur : Paris : Université de Paris 1 Panthéon Sorbonne Année de publication : 2022 Autre Editeur : Champs-sur-Marne : Ecole nationale des sciences géographiques ENSG Importance : 44 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : Mémoire de licence professionnelle Géomatique et environnement Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Bases de données localisées
[Termes IGN] base de données naturalistes
[Termes IGN] biodiversité
[Termes IGN] carte thématique
[Termes IGN] eutrophisation
[Termes IGN] Morbihan (56)
[Termes IGN] QGIS
[Termes IGN] taxinomieIndex. décimale : LPGE Mémoires de Licence professionnelle géomatique et environnement Résumé : (documentaliste) Association loi 1901 dont l'objet est de sensibiliser le public, et particulièrement le jeune public, à la protection de la nature, l'îlot Kergaher a besoin du développement d’outils permettant la valorisation de son site et de sa biodiversité. La structure s'est appuyée sur mes compétences naturalistes et géomatiques pour me faire développer des outils. Il s'agit principalement de créer une base de données géographiques, permettant d'inventorier la biodiversité du site sous forme de taxons et de produire une carte de l'ensemble du site en vectorisant des photographies aériennes et un plan IGN. Note de contenu : 1- Introduction
2- Mes missions
3- Bilan
4- ConclusionNuméro de notice : 28896 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/GEOMATIQUE Nature : Mémoire licence Organisme de stage : Association l’Ilot Kergaher Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=101634 Documents numériques
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L'îlot Kergaher... - pdf auteur -Adobe Acrobat PDF Remise en forme des données géographiques des biotopes en milieu ouvert du Luxembourg / Alexandre Nghien (2022)
Titre : Remise en forme des données géographiques des biotopes en milieu ouvert du Luxembourg : développement d’un plugin QGIS de filtrages attributaires Type de document : Mémoire Auteurs : Alexandre Nghien, Auteur Editeur : Champs-sur-Marne : Ecole nationale des sciences géographiques ENSG Année de publication : 2022 Importance : 53 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : Bibliographie
Rapport de projet pluridisciplinaire, cycle ING2Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Bases de données localisées
[Termes IGN] analyse de données
[Termes IGN] analyse fonctionnelle (produit)
[Termes IGN] base de données naturalistes
[Termes IGN] biotope
[Termes IGN] format Shapefile
[Termes IGN] Luxembourg
[Termes IGN] milieu géographique
[Termes IGN] mise à jour de base de données
[Termes IGN] module d'extension
[Termes IGN] protocole
[Termes IGN] Python (langage de programmation)
[Termes IGN] QGISIndex. décimale : PROJET Mémoires : Rapports de projet - stage des ingénieurs de 2e année Résumé : (auteur) L’Administration de la nature et des forêts du Luxembourg s’occupe chaque année de la surveillance d’une partie des biotopes du pays. Les informations relatives à cette surveillance des biotopes en milieu ouvert des années 2016 à 2020 ont vocation à être importées dans la base de données « Espaces Naturels » du Luxembourg. Cependant, elles comportent des différences significatives entre elles du point de vue de la forme de tableau attributaire ainsi que de nombreuses erreurs géométriques, topologiques et attributaires. Le premier objectif du projet est donc de proposer un protocole de remise en forme, viable sur le long terme, gérant la plupart des exceptions et erreurs possibles et de l’appliquer pour remettre en forme les données géographiques des biotopes en milieu ouvert. L’Union Européenne demande chaque année au Grand-Duché du Luxembourg et particulièrement à l’Administration de la nature et des forêts, des statistiques sur la répartition et l’évolution de leurs biotopes. Un des grands projets de l’administration est d’obtenir à terme une application fonctionnelle de traitement statistique sur les biotopes. Le second objectif du projet est de proposer une maquette opérationnelle d’un plugin QGIS, afin d’effectuer des traitements statistiques sur des couches shapefiles, après filtrage attributaire et requêtes spatiales. Note de contenu : Introduction
1. Préparation du protocole de remise en forme des données géographiques des biotopes en milieu ouvert
1.1 Différentes approches, contraintes et portées du protocole
1.2 Analyse des données et tests
1.3 Mise en place d’un premier protocole et étapes à suivre
2. Résolution, implémentation et application des étapes du protocole
2.1 Résolution des 7 étapes du protocole
2.2 Protocole applicatif et chaîne de traitement
2.3 Applications, statistiques et mise en perspective du protocole
3. Développement d’un plugin de traitements statistiques de biotopes
3.1 Reformulation du besoin, analyse fonctionnelle et portée
3.2 Solutions techniques proposées et solution retenue
3.3 Evolution et mise en perspective
ConclusionNuméro de notice : 26870 Affiliation des auteurs : IGN (2020- ) Thématique : GEOMATIQUE Nature : Mémoire de projet pluridisciplinaire Organisme de stage : Administration de la nature et des forêts Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=101699 Documents numériques
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Remise en forme des données géographiques des biotopes en milieu ouvert du Luxembourg... - pdf auteurAdobe Acrobat PDF Inventaire faune, flore et habitats sur la zone humide de Petelin (Corbelin et Veyrins-Thuellin, Nord-Isère) / Alexandre Gauthier in Lo Parvi, n° 25 (2017)
[article]
Titre : Inventaire faune, flore et habitats sur la zone humide de Petelin (Corbelin et Veyrins-Thuellin, Nord-Isère) Type de document : Article/Communication Auteurs : Alexandre Gauthier, Auteur Année de publication : 2017 Article en page(s) : pp 68 - 80 Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Ecologie
[Termes IGN] base de données naturalistes
[Termes IGN] espace naturel sensible
[Termes IGN] habitat (nature)
[Termes IGN] inventaire de la végétation
[Termes IGN] Isère (38)
[Termes IGN] tourbière
[Termes IGN] zone humideNuméro de notice : A2017-911 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96450
in Lo Parvi > n° 25 (2017) . - pp 68 - 80[article]Documents numériques
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Inventaire faune, flore et habitats sur la zone humide de Petelin - pdf éditeurAdobe Acrobat PDF Automatisation des cartes d’incidences Natura 2000 sur le Massif de Fontainebleau / Yann Petit (2015)
Titre : Automatisation des cartes d’incidences Natura 2000 sur le Massif de Fontainebleau Type de document : Mémoire Auteurs : Yann Petit, Auteur Editeur : Paris : Université de Paris 1 Panthéon Sorbonne Année de publication : 2015 Importance : 70 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : bibliographie Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Géomatique
[Termes IGN] automatisation
[Termes IGN] base de données naturalistes
[Termes IGN] couche thématique
[Termes IGN] Fontainebleau
[Termes IGN] habitat (nature)
[Termes IGN] habitat d'espèce
[Termes IGN] impact sur l'environnement
[Termes IGN] Python (langage de programmation)
[Termes IGN] script (informatique)
[Termes IGN] site Natura 2000
[Termes IGN] traitement de données localiséesIndex. décimale : LPGE Mémoires de Licence professionnelle géomatique et environnement Résumé : (auteur) Le massif de Fontainebleau est un site Natura 2000 ce qui implique des contraintes au niveau de l’accueil du public. C’est pourquoi, des cartes d’incidences sont réalisées pour indiquer aux organisateurs de manifestations les zones à éviter.
Des inventaires naturalistes sur la faune et la flore sont réalisés de façon continue sur le massif de Fontainebleau. Ces données sont enregistrées dans une application appelée Base de Données Naturalistes puis utilisées afin de constituer des habitats d’espèce qui seront utilisées pour constituer les cartes d’incidences. Elles sont à mettre à jour tous les ans et sont définies par période. Une distinction est faite entre les manifestations se déroulant sur les chemins uniquement et celles se déroulant hors chemin. Les premières générant moins de nuisances que les secondes qui provoquent un piétinement des habitats d’espèce et des habitats naturels. L’objectif de ce stage est d’apporter une méthodologie et des outils permettant l’automatisation des traitements nécessaires pour réaliser ces cartes d’incidences.Note de contenu : 1. INTRODUCTION
1.1 Contexte administratif
1.2 Le massif de Fontainebleau et Natura 2000
1.3 Les cartes d’incidences
1.4 Objectif du stage
2. ANALYSE DES DONNÉES EXISTANTES ET DU TRAVAIL RÉALISÉ BIOTOPE
2.1 Inventaire des premières données naturalistes réalisées par BIOTOPE
2.2 Utilisation des données de BIOTOPE
2.3 Méthodologie appliquée pour constituer les cartes d’incidences
3. CONSTITUTION D’UNE BASE DE TRAVAIL
3.1 Définition d’un environnement de travail
3.2 Constitution d’une table des espèces
4. UTILISATION DE L’APPLICATION BDN ET MISE A JOUR DES HABITATS D’ESPÈCE
4.1 Fonctionnement de l’application BDN
4.2 Consultation de l’application BDN et export des données d’inventaire
4.3 Traitements des données BDN avec le logiciel ArcGIS
4.4 Automatisation des traitements pour effectuer la mise à jour des habitats d’espèce
5. UTILISATION DES DONNÉES POUR CONSTITUER DES CARTES D’INCIDENCE
5.1 Automatisation des traitements pour convertir les données en mode raster
5.2 Gestion des fichiers raster des habitats d’espèce
5.3 Gestion des fichiers raster des habitats naturels
5.4 Traitement de la couche des Réserves Biologiques Intégrales
6. CRÉATION DES CARTES D’INCIDENCES
6.1 Constitution des cartes d’incidences pour les manifestations hors chemin
6.2 Constitution des cartes d’incidences pour les manifestations sur chemin
6.3 Mise en page des cartes d’incidences
6.4 Constitution d’un dossier pour la réalisation des cartes d’incidences 2016
7. CONCLUSIONNuméro de notice : 14962 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/GEOMATIQUE Nature : Mémoire licence Organisme de stage : Agence Etudes et Expertises de l’Office National des Forêts de Fontainebleau Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=78129 Exemplaires(1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 14962-01 LPGE Livre Centre de documentation Travaux d'élèves Disponible Documents numériques
peut être téléchargé
14962 Automatisation des cartes d’incidencesAdobe Acrobat PDF Réalisation d'une base de données naturaliste spatiale des études écologiques de l'EPAMSA / Constance De Villeneuve (2012)PermalinkAbundance response of western European forest species along canopy openness and soil pH gradients / Rosalinde van Couwenberghe in Forest ecology and management, vol 262 n° 8 ([15/10/2011])PermalinkPermalinkLa base de données écologiques de l’IFN / Jacques Drapier in Revue forestière française, vol 53 n° 3-4 (mai - août 2001)PermalinkPremiers enseignements de l’utilisation du logiciel Ecoflore pour traiter les relevés botaniques de l’IFN / Eric Bruno in Revue forestière française, vol 53 n° 3-4 (mai - août 2001)PermalinkSIGOGNE, le SIG du parc de Bretonne au service de l'environnement / F. Bassien in Géomatique expert, n° 6 (01/06/2000)Permalink