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Auteur Antoine Kremer
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INRA, UMR BioGeCo, Centre de Bordeaux, Pierroton
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Affiner la recherche Interroger des sources externesGenome-wide evolutionary response of European oaks during the Anthropocene / Dounia Saleh in Evolution letters, vol 6 n° 1 (February 2022)
Titre : Genome-wide evolutionary response of European oaks during the Anthropocene Type de document : Article/Communication Auteurs : Dounia Saleh, Auteur ; Jun Chen, Auteur ; Jean-Charles Leple, Auteur ; Thibault Leroy, Auteur ; Laura Truffaut, Auteur ; Benjamin Dencausse, Auteur ; Céline Lalanne, Auteur ; Karine Labadie, Auteur ; Isabelle Lesur, Auteur ; Didier Bert, Auteur ; Frédéric Lagane, Auteur ; François Morneau Année de publication : 2022 Projets : 3-projet - voir note / Article en page(s) : pp 4 - 20 Note générale : bibliographie
This research was supported by the European Research Council through an Advanced Grant (project TREEPEACE # FP7-339728), by France Génomique (project EVOL-OAK, ANR-10-INBS-09-08), and by the French Forest Service (ONF) (INRAE-ONF TREEPEACE contract).Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] dix-huitième siècle
[Termes IGN] dix-neuvième siècle
[Termes IGN] France (géographie physique)
[Termes IGN] génétique forestière
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] vingt-et-unième siècle
[Termes IGN] vingtième siècle
[Vedettes matières IGN] BotaniqueRésumé : (auteur) The pace of tree microevolution during Anthropocene warming is largely unknown. We used a retrospective approach to monitor genomic changes in oak trees since the Little Ice Age (LIA). Allelic frequency changes were assessed from whole-genome pooled sequences for four age-structured cohorts of sessile oak (Quercus petraea) dating back to 1680, in each of three different oak forests in France. The genetic covariances of allelic frequency changes increased between successive time periods, highlighting genome-wide effects of linked selection. We found imprints of parallel linked selection in the three forests during the late LIA, and a shift of selection during more recent time periods of the Anthropocene. The changes in allelic covariances within and between forests mirrored the documented changes in the occurrence of extreme events (droughts and frosts) over the last 300 years. The genomic regions with the highest covariances were enriched in genes involved in plant responses to pathogens and abiotic stresses (temperature and drought). These responses are consistent with the reported sequence of frost (or drought) and disease damage ultimately leading to the oak dieback after extreme events. They provide support for adaptive evolution of long-lived species during recent climatic changes. Although we acknowledge that other sources (e.g., gene flow, generation overlap) may have contributed to temporal covariances of allelic frequency changes, the consistent and correlated response across the three forests lends support to the existence of a systematic driving force such as natural selection. Numéro de notice : A2022-076 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2020- ) Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1002/evl3.269 Date de publication en ligne : 05/01/2022 En ligne : https://doi.org/10.1002/evl3.269 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=99572
in Evolution letters > vol 6 n° 1 (February 2022) . - pp 4 - 20[article]
Titre : La gestion de la variabilité génétique dans le programme d’amélioration du Pin maritime (Pinus pinaster Ait.) Type de document : Article/Communication Auteurs : Laurent Bouffier, Auteur ; Annie Raffin, Auteur ; Antoine Kremer, Auteur Année de publication : 2009 Article en page(s) : p. 369-388 Note générale : Bibliogr. Résumé en français et anglais Langues : Français (fre) Descripteur : [Termes IGN] génétique forestière
[Termes IGN] Landes de Gascogne
[Termes IGN] phytobiologie
[Termes IGN] Pinus pinaster
[Vedettes matières IGN] BotaniqueRésumé : (Auteur) "Les Landes de Gascogne sont très majoritairement couvertes par une vaste forêt cultivée de Pin maritime. Le programme d’amélioration génétique a permis d’améliorer sensiblement à la fois la croissance et la rectitude basale des arbres. Une étude rétrospective montre que la stratégie de sélection suivie a maintenu suffisamment de variabilité sur les critères de sélection pour assurer la poursuite du programme sur plusieurs générations. Toutefois, l’évolution des demandes de la société et les changements climatiques à venir nécessitent une adaptation des critères et des méthodes de sélection." Numéro de notice : IFN_5270 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article DOI : 10.4267/2042/30547 En ligne : https://doi.org/10.4267/2042/30547 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=73191
in Revue forestière française > vol 61 n° 4 (juillet - août 2009) . - p. 369-388[article]Exemplaires(5)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 133-09041 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible IFN-001-P000775 PER Revue Nogent-sur-Vernisson Archives périodiques Exclu du prêt IFN-001-P000832 PER Revue Nogent-sur-Vernisson Salle périodiques Exclu du prêt IFN-001-P000777 PER Revue Nogent-sur-Vernisson Salle périodiques Exclu du prêt IFN-001-P000776 PER Revue Nogent-sur-Vernisson Salle périodiques Exclu du prêt 
Titre : Leaf morphological differentiation between Quercus robur and Quercus petraea is stable across western European mixed oak stands Type de document : Article/Communication Auteurs : Antoine Kremer, Auteur ; Jean-Luc Dupouey, Auteur ; J. Douglas Deans, Auteur ; Joan Cottrell, Auteur ; Ulrike Csaikl, Auteur ; Reiner Finkeldey, Auteur ; Santiago Espinel, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2002 Article en page(s) : pp 777 - 787 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Végétation
[Termes IGN] Europe occidentale
[Termes IGN] feuille (végétation)
[Termes IGN] peuplement forestier
[Termes IGN] Quercus pedunculata
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] taxinomieMots-clés libres : morphology leaf Quercus robur Quercus petraea taxonomy Résumé : (auteur) Leaf morphology was assessed in nine mixed oak stands (Quercus petraea and Q. robur) located in eight European countries. Exhaustive sampling was used in an area of each stand where the two species coexisted in approximately equal proportions (about 170 trees/species/ stand). Fourteen leaf characters were assessed on each of 5 to10 leaves collected from the upper part of each tree. Three multivariate statistical techniques (CDA, canonical discriminant analysis; PCA, principal component analysis; MCA, multiple correspondence analysis) were used in two different ways: first on the total set of leaves over all stands (global analysis) and second, separately within each stand (local analysis). There was a general agreement of the results among the statistical methods used and between the analyses conducted (global and local). The first synthetic variable derived by each multivariate analysis exhibited a clear and sharp bimodal distribution, with overlapping in the central part. The two modes were interpreted as the two species, and the overlapping region was interpreted as an area where the within-species variations were superimposed. There was no discontinuity in the distribution or no visible evidence of a third mode which would have indicated the existence of a third population composed of trees with intermediate morphologies. Based on petiole length and number of intercalary veins, an “easy to use” discriminant function applicable to a major part of the natural distribution of the species was constructed. Validation on an independent set of trees provided a 98% rate of correct identification. The results were interpreted in the light of earlier reports about extensive hybridization occurring in mixed oak stands. Maternal effects on morphological characters, as well as a lower frequency or fitness of hybrids in comparison with parent species could explain the maintenance of two modes, which might be composed of either pure species or pure species and introgressed forms. Numéro de notice : A2002-055 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article DOI : 10.1051/forest:2002065 En ligne : http://dx.doi.org/10.1051/forest:2002065 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=81013
in Annals of Forest Science > vol 59 n° 7 (novembre 2002) . - pp 777 - 787[article]Documents numériques
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Titre : Comparison of morphological characters and molecular markers for the analysis of hybridization in sessile and pedunculate oak Type de document : Article/Communication Auteurs : R. Bacilieri, Auteur ; Alexis Ducousso, Auteur ; Antoine Kremer, Auteur Année de publication : 1996 Article en page(s) : pp 79 - 91 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Végétation
[Termes IGN] hybridation naturelle (végétation)
[Termes IGN] morphologie
[Termes IGN] Quercus pedunculata
[Termes IGN] Quercus sessilifloraRésumé : (auteur) Comparaison des caractères morphologiques et des marqueurs moléculaires pour l'analyse de l'hybridation entre les chênes sessile et pédonculé. L'hybridation interspécifique est un phénomène courant chez de nombreux groupes végétaux, mais la morphologie des hybrides a été rarement étudiée sur des bases expérimentales. Les chêne sessile et pédonculé sont deux espèces étroitement apparentées, qui peuvent naturellement s'hybrider. Toutefois, la morphologie de leurs hybrides reste encore peu connue. Dans ce travail, nous étudions la morphologie et le taux d'hybridation chez les descendances issues de pollinisation libre récoltées dans un peuplement naturel de chêne sessile et pédonculé. Les effets de l'environnement pollinique intra ou interspécifique ont été étudiés à l'aide de la morphologie foliaire et de marqueurs moléculaires. Ces derniers ont montré que la contribution du chêne sessile aux descendances de chêne pédonculé est significativement positive mais pas l'inverse. Les effets génétiques des différents environnements polliniques sont significatifs. Les caractères morphologiques donnent une meilleure image du flux génique interspécifique quand ils sont considérés globablement dans une analyse multivariée que lorsqu'ils sont considérés séparement dans une analyse univariée. Ce résultat laisse penser que les hybrides sont une mosaïque de caractères parentaux et intermédiaires, plutôt que des formes exactement intermédiaires. Numéro de notice : A1996-014 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Article DOI : sans En ligne : http://dx.doi.org/10.1051/forest:19960106 Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=81069
in Annales des Sciences forestières > vol 53 n° 1 [01/02/1996] . - pp 79 - 91[article]Documents numériques
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