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An evaluation of multi-species empirical tree mortality algorithms for dynamic vegetation modelling / Timothy Thrippleton in Scientific reports, vol 11 (2021)
[article]
Titre : An evaluation of multi-species empirical tree mortality algorithms for dynamic vegetation modelling Type de document : Article/Communication Auteurs : Timothy Thrippleton, Auteur ; Lisa Hülsmann, Auteur ; Maxime Cailleret, Auteur ; Harald Bugmann, Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : n° 19845 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] Abies alba
[Termes IGN] Betula pendula
[Termes IGN] dynamique de la végétation
[Termes IGN] Europe (géographie politique)
[Termes IGN] Fagus sylvatica
[Termes IGN] forêt ancienne
[Termes IGN] modélisation de la forêt
[Termes IGN] mortalité
[Termes IGN] Picea abies
[Termes IGN] Pinus sylvestris
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Vedettes matières IGN] Végétation et changement climatiqueRésumé : (auteur) Tree mortality is key for projecting forest dynamics, but difficult to portray in dynamic vegetation models (DVMs). Empirical mortality algorithms (MAs) are often considered promising, but little is known about DVM robustness when employing MAs of various structures and origins for multiple species. We analysed empirical MAs for a suite of European tree species within a consistent DVM framework under present and future climates in two climatically different study areas in Switzerland and evaluated their performance using empirical data from old-growth forests across Europe. DVM projections under present climate showed substantial variations when using alternative empirical MAs for the same species. Under climate change, DVM projections showed partly contrasting mortality responses for the same species. These opposing patterns were associated with MA structures (i.e. explanatory variables) and occurred independent of species ecological characteristics. When comparing simulated forest structure with data from old-growth forests, we found frequent overestimations of basal area, which can lead to flawed projections of carbon sequestration and other ecosystem services. While using empirical MAs in DVMs may appear promising, our results emphasize the importance of selecting them cautiously. We therefore synthesize our insights into a guideline for the appropriate use of empirical MAs in DVM applications. Numéro de notice : A2021-964 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article DOI : 10.1038/s41598-021-98880-2 Date de publication en ligne : 06/10/2021 En ligne : http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-98880-2 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=100136
in Scientific reports > vol 11 (2021) . - n° 19845[article]Long-term tree species population dynamics in Swiss forest reserves influenced by forest structure and climate / Amanda S. Mathys in Forest ecology and management, vol 481 (February 2021)
[article]
Titre : Long-term tree species population dynamics in Swiss forest reserves influenced by forest structure and climate Type de document : Article/Communication Auteurs : Amanda S. Mathys, Auteur ; P. Brang, Auteur ; J. Stillhard, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : n° 118666 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] Abies alba
[Termes IGN] Acer pseudoplatanus
[Termes IGN] analyse diachronique
[Termes IGN] changement climatique
[Termes IGN] diamètre à hauteur de poitrine
[Termes IGN] dynamique de la végétation
[Termes IGN] écosystème forestier
[Termes IGN] Fagus sylvatica
[Termes IGN] Fraxinus excelsior
[Termes IGN] inventaire forestier étranger (données)
[Termes IGN] mortalité
[Termes IGN] Pinus sylvestris
[Termes IGN] Quercus (genre)
[Termes IGN] réserve forestière
[Termes IGN] structure d'un peuplement forestier
[Termes IGN] Suisse
[Vedettes matières IGN] Végétation et changement climatiqueRésumé : (auteur) Changes in tree species composition can have strong effects on ecosystem functioning and the services provided by forests. Empirical observations can provide an improved understanding of the drivers of species population dynamics, yet long-term datasets are scarce in natural forests. This study used inventory data of the Swiss forest reserve network to assess tree population dynamics over the past 60 years. Tree status, species and dbh were repeatedly measured between 1956 and 2018 in 211 permanent plots of 34 forest reserves that covered a wide environmental gradient. Differences in species richness and tree density were compared between the first and last inventory. Furthermore, we used generalized linear mixed effect models to estimate the processes of ingrowth and tree mortality of seven abundant species (Abies alba, Acer pseudoplatanus, Fagus sylvatica, Fraxinus excelsior, Picea abies, Pinus sylvestris and Quercus spp.) separately as a function of stand structural attributes and climate. We found a general decline in the density of the dominant species, with a low recruitment of light-demanding species and an increase in species richness, particularly in the colline vegetation zone. Both species-specific ingrowth and tree mortality were influenced by stand density and climate variables. Tree mortality increased with live tree density and increasing temperature. Ingrowth increased with tree density and decreased with higher temperature. Therefore, forest structural properties and climate have a strong influence on species population dynamics, and both are essential for predicting ingrowth and tree mortality in forest ecosystems. Numéro de notice : A2021-224 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article DOI : 10.1016/j.foreco.2020.118666 Date de publication en ligne : 28/10/2020 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.foreco.2020.118666 Format de la ressource électronique : url article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=97199
in Forest ecology and management > vol 481 (February 2021) . - n° 118666[article]Effects of different site preparation methods on the root development of planted Quercus petraea and Pinus nigra / Mathieu Dassot in New forests, vol 52 n° 1 (January 2021)
[article]
Titre : Effects of different site preparation methods on the root development of planted Quercus petraea and Pinus nigra Type de document : Article/Communication Auteurs : Mathieu Dassot , Auteur ; Catherine Collet, Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : pp 17 - 30 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] phytobiologie
[Termes IGN] Pinus nigra
[Termes IGN] plantation forestière
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] système radiculaire
[Vedettes matières IGN] BotaniqueRésumé : (auteur) Mechanical site preparation (MSP) is often performed prior to planting to improve the growth and survival of planted seedlings. In this study, we compared root development of 5-years-old Quercus petraea and Pinus nigra seedlings planted in plots that had been prepared with different methods, i.e. deep scarification, deep scarification combined with mounding-subsoiling, herbicide and a control without preparation. Seventy-two trees were excavated (36 per species) and their root system was measured by recording points in a three-dimensional space along their roots. The variation of the number of roots with depth and distance to root collar was assessed and analysed, as well as the root projection area. Our results showed that root development was better in the plots with mechanical preparation, for both Q. petraea and P. nigra, when compared to the control. Combining mounding to subsoiling made the roots extending deeper, especially for Q. petraea. A strong relationship was found between root projection area and root collar diameter, indicating the primary effect of lateral root spread on tree growth. The herbicide treatment induced the highest root growth, which raised questions about the potential negative effects of changes in soil properties caused by MSP methods. Numéro de notice : A2021-965 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1007/s11056-020-09781-7 En ligne : http://dx.doi.org/10.1007/s11056-020-09781-7 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=101352
in New forests > vol 52 n° 1 (January 2021) . - pp 17 - 30[article]
Titre : Genome-wide evolutionary response of European oaks since the Little Ice Age Type de document : Article/Communication Auteurs : Dounia Saleh, Auteur ; Jun Chen, Auteur ; Jean-Charles Leple, Auteur ; Thibault Leroy, Auteur ; Laura Truffaut, Auteur ; Benjamin Dencausse, Auteur ; et al., Auteur ; François Morneau , Auteur Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE (2020-) Année de publication : 2021 Projets : 3-projet - voir note / Importance : 35 p. Note générale : bibliographie
This research was supported by the European Research Council through an Advanced Grant (project TREEPEACE # FP7-339728), by France Génomique (project EVOL-OAK, ANR-10-INBS-09–08), and by the French Forest Service (ONF) (INRAE-ONF TREEPEACE contract).Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] dix-huitième siècle
[Termes IGN] dix-neuvième siècle
[Termes IGN] dix-septième siècle
[Termes IGN] France (géographie physique)
[Termes IGN] génétique forestière
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] quinzième siècle
[Termes IGN] seizième siècle
[Vedettes matières IGN] BotaniqueRésumé : (auteur) The pace of tree microevolution during Anthropocene warming is largely unknown. We used a retrospective approach to monitor genomic changes in oak trees since the Little Ice Age (LIA). Allelic frequency changes were assessed from whole-genome pooled sequences for four age-structured cohorts of sessile oak (Quercus petraea) dating back to 1680, in each of three different oak forests in France. The genetic covariances of allelic frequency changes increased between successive time periods, highlighting genome-wide effects of linked selection. We found imprints of convergent linked selection in the three forests during the late LIA, and a shift of selection during more recent time periods. The changes in allelic covariances within and between forests mirrored the documented changes in the occurrence of extreme events (droughts and frosts) over the last three hundred years. The genomic regions with the highest covariances were enriched in genes involved in plant responses to pathogens and abiotic stresses (temperature and drought). These responses are consistent with the reported sequence of frost (or drought) and disease damage ultimately leading to the oak dieback after extreme events. Our results therefore provide evidence of selection operating on long-lived species during recent climatic changes. Numéro de notice : P2021-004 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2020- ) Thématique : FORET Nature : Preprint nature-HAL : Préprint DOI : 10.1101/2021.05.25.445558 Date de publication en ligne : 27/05/2021 En ligne : https://doi.org/10.1101/2021.05.25.445558 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=97846 Interactions between oak and cervids during the process of forest regeneration / Julien Barrere (2021)
Titre : Interactions between oak and cervids during the process of forest regeneration : the case study of plain temperate oak stands (Quercus robur et Q. petraea) Type de document : Thèse/HDR Auteurs : Julien Barrere, Auteur ; Sonia Saïd, Directeur de thèse ; Catherine Collet, Directeur de thèse Editeur : Nancy, Metz : Université de Lorraine Année de publication : 2021 Importance : 315 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : Bibliographie
Thèse pour obtenir le grade de Docteur de L'Université d'Orléans, Spécialité Biologie et écologie des forêts et des agrosystèmesLangues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] analyse spatio-temporelle
[Termes IGN] canopée
[Termes IGN] Cervidae
[Termes IGN] données spatiotemporelles
[Termes IGN] écosystème forestier
[Termes IGN] faune locale
[Termes IGN] forêt tempérée
[Termes IGN] inventaire forestier local
[Termes IGN] migration animale
[Termes IGN] peuplement forestier
[Termes IGN] Quercus pedunculata
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] régénération (sylviculture)
[Termes IGN] Suède
[Termes IGN] Vosges, massif des
[Vedettes matières IGN] ForesterieIndex. décimale : THESE Thèses et HDR Résumé : (Auteur) Les cervidés ont vu leur abondance et leur distribution spatiale augmenter fortement depuis les dernières décennies, en France, et plus généralement à l’échelle de l’hémisphère Nord. Si ces espèces jouent un rôle clé dans le fonctionnement des écosystèmes forestiers, le niveau actuel des populations compromet le processus de régénération forestière de certaines essences cruciales pour la filière sylvicole telles que les chênes sessile et pédonculé (Quercus robur et Q. petraea). L’objectif de cette thèse est de quantifier et décrire les mécanismes sous-jacent de la contrainte exercée par les cervidés sur la régénération et d’identifier dans quelle mesure certaines opérations sylvicoles (coupe, dégagement et pose d’enclos) influencent cette contrainte. L’analyse de la composition de panses de cerf et de chevreuil sur le site de La Petite Pierre (Vosges) a permis de montrer que les glands de chêne représentaient une ressource significative dans le régime alimentaire de ces deux espèces, mais que leur consommation de gland saturait les années de forte fructification. Par des approches expérimentales, nous avons mis en évidence que l’abroutissement de la pousse apicale réduisait toujours la croissance en hauteur des semis que ce soit en condition de terrain, ou en pépinière, et que ce phénomène s’expliquait par une faible plasticité d’allocation des ressources pour compenser la perte de tissu. L’analyse d’un résultat d’un réseau d’enclos-exclos répartis sur plusieurs sites en France et en Suède a permis de montrer que la coupe d’arbre adulte pour augmenter l’ouverture de la canopée accentuait l’effet négatif des cervidés sur la croissance et la survie de jeunes semis de chêne, via une plus forte fréquentation des cervidés dans les patches de régénération ouverts. Enfin, suite à l’implémentant du processus d’herbivorie dans un modèle de dynamique forestière (bibliothèque Régénération de CAPSIS), j’ai effectué des simulations suggérant que sous une forte pression d’herbivorie, des opérations de dégagement moins fréquentes et maintenant des espèces accompagnatrices appétentes comme le charme permettrait de réduire l’influence négative des cervidés sur la croissance du chêne. En conclusion, les résultats de cette thèse étayent l’hypothèse que les cervidés représentent une contrainte significative pour le processus de régénération du chêne, mais suggère qu’une gestion de la végétation de sous-bois adaptée permettrait de réduire cette contrainte et de se rapprocher d’un équilibre plus durable entre faune sauvage et activités sylvicoles. Note de contenu :
CHAPTER 1 - Introduction
1.1 The anthropic origin of an imbalance between forest trees and wildlife
1.2 Managing the balance between forests and large herbivores
1.3 Presentation of the studied species and their specificity
1.4 On the drivers and constraints of oak regeneration
1.5 Interactions between oak and cervids throughout the regeneration process, and remaining knowledge gaps
1.6 Objective of the thesis and structure of the manuscript
CHAPTER 2 - Scientific Approaches
2.1 Observational data for the study of spatial and temporal patterns
2.2 Experimental approaches to studying forest-deer interactions
2.3 An in silico approach to synthesize multiple data sources
2.4 Conclusion
CHAPTER 3 - How does oak mast seeding affect the feeding behaviour of sympatric red and roe deer ?
3.1 Abstract
3.2 Introduction
3.3 Materials and methods
3.4 Results
3.5 Discussion
3.6 Conclusion
3.7 Acknowledgments
3.8 Appendices
CHAPTER 4 - Do trait responses to simulated browsing in Quercus robur saplings affect their attractiveness to Capreolus capreolus the following year?
4.1 Abstract
4.2 Introduction
4.3 Material and methods
4.4 Results
4.5 Discussion
4.6 Conclusions
4.7 Funding
4.8 Authorship
4.9 Acknowledgments
4.10 Appendices
CHAPTER 5 - Oak responses to browsing in field conditions
5.1 Context and objective
5.2 Overview of the methodology
5.3 Results
5.4 Conclusion
CHAPTER 6 - Canopy openness and exclusion of wild ungulates act synergistically to improve oak natural regeneration
6.1 Abstract
6.2 Introduction
6.3 Material and methods
6.4 Results
6.5 Discussion
6.6 Conclusion
6.7 Acknowledgments
6.8 Appendices
CHAPTER 7 - The influence of deer browsing on oak regeneration is conditioned by the shrub layer - insights from a modeling approach
7.1 Preamble
7.2 Introduction
7.3 Including deer browsing in the CAPSIS regeneration library
7.4 A first set of simulations
7.5 Perspectives and conclusion
CHAPTER 8 - Discussion and perspectives
8.1 Overview of the results
8.2 Perspectives
8.3 General conclusion
CHAPTER 9 - Résumé de la thèse en Français
9.1 Introduction
9.2 Influence du masting du chêne sur le comportement alimentaire du cerf et du chevreuil
9.3 Réponse des jeunes chênes à l’abroutissement, et conséquence pour l’attractivité du plant
9.4 Influence croisée de l’ouverture de la canopée et de l’exclusion des ongulés sauvages sur la régénération du chêne
9.5 L’influence de l’abroutissement sur la régénération du chêne est conditionné par la végétation accompagnatrice
9.6 Synthèse et perspectivesNuméro de notice : 26952 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Thèse française Note de thèse : Thèse de Doctorat : Biologie et écologie des forêts et des agrosystèmes : Lorraine : 2021 Organisme de stage : Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement INRAE DOI : sans Date de publication en ligne : 11/01/2023 En ligne : https://hal.univ-lorraine.fr/tel-03702537v1/document Format de la ressource électronique : URL Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=102436 Is Xylella fastidiosa a serious threat to European forests? / Marie-Laure Desprez-Loustau in Forestry, an international journal of forest research, vol 94 n° 1 (January 2021)PermalinkRange-wide demographic patterns in European forests along climatic marginality gradients : An approach using national forest inventories / Alexandre Changenet (2021)PermalinkThe strong and the stronger: The effects of increasing ozone and nitrogen dioxide concentrations in pollen of different forest species / Sónia Pereira in Forests, vol 12 n° 1 (January 2021)PermalinkClimate sensitive single tree growth modeling using a hierarchical Bayes approach and integrated nested Laplace approximations (INLA) for a distributed lag model / Arne Nothdurft in Forest ecology and management, vol 478 ([15/12/2020])PermalinkCompetition overrides climate as trigger of growth decline in a mixed Fagaceae Mediterranean rear-edge forest / Alvaro Rubio-Cuadrado in Annals of Forest Science, vol 77 n° 4 (December 2020)PermalinkIs field-measured tree height as reliable as believed – Part II, A comparison study of tree height estimates from conventional field measurement and low-cost close-range remote sensing in a deciduous forest / Luka Jurjević in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 169 (November 2020)PermalinkChloroplast haplotypes of Northern red oak (Quercus rubra L.) stands in Germany suggest their origin from Northeastern Canada / Jeremias Götz in Forests, vol 11 n° 9 (September 2020)PermalinkEcology and management of northern red oak (Quercus rubra L. syn. Q. borealis F. Michx.) in Europe: a review / Valeriu-Norocel Nicolescu in Forestry, an international journal of forest research, vol 93 n° 4 (July 2020)PermalinkDecreasing stand density favors resistance, resilience, and recovery of Quercus petraea trees to a severe drought, particularly on dry sites / Anna Schmitt in Annals of Forest Science, Vol 77 n° 2 (June 2020)PermalinkStand growth and structure of mixed-species and monospecific stands of Scots pine (Pinus sylvestris L.) and oak (Q. robur L., Quercus petraea (MATT.) LIEBL.) analysed along a productivity gradient through Europe / Hans Pretzsch in European Journal of Forest Research, vol 139 n° 3 (June 2020)Permalink