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Effect of riparian soil moisture on bacterial, fungal and plant communities and microbial decomposition rates in boreal stream-side forests / M.J. Annala in Forest ecology and management, vol 519 (1 September 2022)  

Public [article]  inForest ecology and management > vol 519 (1 September 2022) . - n° 120344 Titre : Effect of riparian soil moisture on bacterial, fungal and plant communities and microbial decomposition rates in boreal stream-side forests Type de document : Article/Communication Auteurs : M.J. Annala, Auteur ; K. Lehosmaa, Auteur ; S.H.K. Ahonen, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2022 Article en page(s) : n° 120344 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] cours d'eau [Termes IGN] écosystème forestier [Termes IGN] Finlande [Termes IGN] forêt boréale [Termes IGN] forêt ripicole [Termes IGN] Fungi [Termes IGN] humidité du sol [Termes IGN] micro-organisme [Termes IGN] plante ripicole [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] zone tampon [Vedettes matières IGN] Ecologie forestière Résumé : (auteur) Riparian habitats of boreal forests are considered as hotspots for biochemical processes and biodiversity, and varying width riparian buffers have been proposed to protect species diversity of the riparian forests. However, evidence of the role of soil moisture variation in shaping riparian biodiversity and ecosystem functioning remain scarce particularly regarding belowground diversity. We studied how distance from the stream and soil moisture of the riparian zone affected species richness and community composition of plants, bacteria, and fungi as well as microbial decomposition rates. Using a split-plot design with a plant survey and amplicon sequencing for microorganisms we identified taxa associated with different categories of moisture and distance from the stream along six headwater stream-sides in middle boreal forests in Northern Finland. Tea-bag Index was used to assess the decomposition rates. PERMANOVA and linear mixed-effect models were used to analyze the data. Variation in riparian soil moisture influenced species composition and richness of plants and bacteria. Plant communities also changed from herbaceous dominated to shrub dominated with increasing distance from the stream. Fungal communities, however, did not respond to soil moisture or distance from the stream, and there were only slight differences in fungal trophic guilds among moisture and distance categories. Decomposition of organic material by microorganisms was faster adjacent to the stream than further away, and moist riparian areas had higher decomposition rates than drier ones. Decomposition rates were positively related to pH, Ca, Mg and NH4 and soil temperature. Synthesis and applications We show that above- and belowground diversity and microbial decomposition are associated to soil moisture at riparian sites supporting the idea of leaving wider unmanaged buffers in moist habitats to safeguard the overall forest diversity. Our findings further emphasize the need to consider soil moisture when planning the measures for riparian protection as changes in riparian soil moisture could lead to deterioration of organic matter decomposition. Different responses of the examined plant and microbial communities to riparian soil conditions clearly imply that overall riparian diversity cannot be explained based on a single community type, and that different organisms may respond differently to human-induced changes in stream riparian zone. Numéro de notice : A2022-485 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Article DOI : 10.1016/j.foreco.2022.120344 Date de publication en ligne : 04/06/2022 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.foreco.2022.120344 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=100923 [article]

A framework for urban land use classification by integrating the spatial context of points of interest and graph convolutional neural network method / Yongyang Xu in Computers, Environment and Urban Systems, vol 95 (July 2022)  

Public [article]  inComputers, Environment and Urban Systems > vol 95 (July 2022) . - n° 101807 Titre : A framework for urban land use classification by integrating the spatial context of points of interest and graph convolutional neural network method Type de document : Article/Communication Auteurs : Yongyang Xu, Auteur ; Bo Zhou, Auteur ; Shuai Jin, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2022 Article en page(s) : n° 101807 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Analyse spatiale [Termes IGN] apprentissage profond [Termes IGN] arbre aléatoire minimum [Termes IGN] distribution spatiale [Termes IGN] noeud [Termes IGN] Pékin (Chine) [Termes IGN] planification urbaine [Termes IGN] point d'intérêt [Termes IGN] réseau neuronal de graphes [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] trafic routier [Termes IGN] triangulation de Delaunay [Termes IGN] utilisation du sol [Termes IGN] zone urbaine Résumé : (auteur) Land-use classification plays an important role in urban planning and resource allocation and had contributed to a wide range of urban studies and investigations. With the development of crowdsourcing technology and map services, points of interest (POIs) have been widely used for recognizing urban land-use types. However, current research methods for land-use classifications have been limited to extracting the spatial relationship of POIs in research units. To close this gap, this study uses a graph-based data structure to describe the POIs in research units, with graph convolutional networks (GCNs) being introduced to extract the spatial context and urban land-use classification. First, urban scenes are built by considering the spatial context of POIs. Second, a graph structure is used to express the scenes, where POIs are treated as graph nodes. The spatial distribution relationship of POIs is considered to be the graph's edges. Third, a GCN model is designed to extract the spatial context of the scene by aggregating the information of adjacent nodes within the graph and urban land-use classification. Thus, the land-use classification can be treated as a classification on a graphic level through deep learning. Moreover, the POI spatial context can be effectively extracted during classification. Experimental results and comparative experiments confirm the effectiveness of the proposed method. Numéro de notice : A2022-460 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article DOI : 10.1016/j.compenvurbsys.2022.101807 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.compenvurbsys.2022.101807 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=100622 [article]

Developing reliably distinguishable color schemes for legends of natural resource taxonomy-based maps / Virgil Vlad in Cartography and Geographic Information Science, Vol 48 n° 5 (September 2021)  

Public [article]  inCartography and Geographic Information Science > Vol 48 n° 5 (September 2021) . - pp 393 - 416 Titre : Developing reliably distinguishable color schemes for legends of natural resource taxonomy-based maps Type de document : Article/Communication Auteurs : Virgil Vlad, Auteur ; Mihai Toti, Auteur ; Sorina Dumitru, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : pp 393 - 416 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Rédaction cartographique [Termes IGN] carte d'occupation du sol [Termes IGN] colorimétrie [Termes IGN] couleur (rédaction cartographique) [Termes IGN] couleur primaire [Termes IGN] lecture de carte [Termes IGN] légende cartographique [Termes IGN] palette de couleurs [Termes IGN] ressources naturelles [Termes IGN] Roumanie [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] visualisation cartographique Résumé : (auteur) The legends of natural resource taxonomy-based maps (e.g. soil, geological, geomorphological, vegetation, and land cover/land use) need many different distinguishable colors. The existing methods of color selection for map legends are based on the designer subjectivity, ensuring schemes having few colors. An analysis of the modeling and management of colors in digital applications has led to define an algorithm to calculate an objective colorimetric measure of color difference – “DE*ab” – based on the perceptually uniform color model CIELAB. The proposed method consists of a set of specific rules for developing hierarchically structured color schemes and a specific procedure for ensuring selection of a large number of reliably distinguishable colors, based on a color difference threshold. The accuracy of color reproduction in printing processes is also taken into account. The method has been applied to develop a standard of colors for soil maps. It contains 63 colors and has been used for developing a soil map having 41 standard colors. A user test of the method results proved that thresholds of 10 DE*ab units and 15 DE*ab units ensure obtaining acceptably distinguishable colors for displaying/printing maps by using high-quality, respectively, current devices. Three datasets that support the research are given. Numéro de notice : A2021-643 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article DOI : 10.1080/15230406.2021.1942218 Date de publication en ligne : 23/08/2021 En ligne : https://doi.org/10.1080/15230406.2021.1942218 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=98340 [article]

Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) of wood reveals distinct chemical signatures of two species of Afzelia / Peter Kitin in Annals of Forest Science [en ligne], vol 78 n° 2 (June 2021)  

Public [article]  inAnnals of Forest Science [en ligne] > vol 78 n° 2 (June 2021) . - Article 31 Titre : Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) of wood reveals distinct chemical signatures of two species of Afzelia Type de document : Article/Communication Auteurs : Peter Kitin, Auteur ; Edgard Espinoza, Auteur ; Hans Beeckman, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : Article 31 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Traitement d'image [Termes IGN] abattage (sylviculture) [Termes IGN] Afzelia (genre) [Termes IGN] analyse discriminante [Termes IGN] apprentissage non-dirigé [Termes IGN] bois [Termes IGN] espèce végétale [Termes IGN] forêt tropicale [Termes IGN] identification de plantes [Termes IGN] signature spectrale [Termes IGN] spectrométrie [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] temps réel Résumé : (Auteur) Distinct chemical fingerprints of the wood of Afzelia pachyloba and A. bipindensis demonstrated an effective method for identifying these two commercially important species. Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) allowed high-throughput examination of chemotypes with vast potential in taxonomic, ecological, and forensic research of wood. Context : Afzelia is a genus of valuable tropical timber trees. Accurate identification of wood is required for the prevention of illicit timber trade as well as for certification purposes in the forest and wood products industry. For many years, particular interest has been focused on attempts to distinguish the wood of A. bipindensis Harms from A. pachyloba Harms due to substantial differences in the commercial values of these two species. Aims : We investigated if wood chemical signatures and microscopy could identify the wood of A. bipindensis and A. pachyloba. Methods : We used two approaches, namely metabolome profiling by direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) and wood microstructure by light microscopy and SEM. In all, we analyzed samples from 89 trees of A. bipindensis, and A. pachyloba. Results : The two species could not be separated by the IAWA standard microscopic wood features. SEM analysis showed considerable variation in the morphology of vestured pits; however, this variation was not species-specific. In contrast, DART-TOFMS followed by unsupervised statistics (Discriminant Analysis of Principal Components) showed distinct metabolome signatures of the two species. Conclusion : DART-TOFMS provides a rapid method for wood identification that can be easily applied to small heartwood samples. Time- and cost-effective classification of wood chemotypes by DART-TOFMS can have potential applications in various research questions in forestry, wood science, tree-ecophysiology, and forensics. Numéro de notice : A2021-327 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1007/s13595-020-01024-1 Date de publication en ligne : 31/03/2021 En ligne : https://doi.org/10.1007/s13595-020-01024-1 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=97488 [article]

Apport de la modélisation physique pour la cartographie de la biodiversité végétale en forêts tropicales par télédétection optique / Dav Ebengo Mwampongo (2021)  

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Format : 21 x 30 cm Note générale : bibliographie Thèse pour obtenir le grade de Docteur de l'Institut National des Sciences et Industries du Vivant et de l'Environnement- AgroParisTech Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Applications de télédétection [Termes IGN] analyse de sensibilité [Termes IGN] biodiversité végétale [Termes IGN] carte forestière [Termes IGN] diagnostic foliaire [Termes IGN] forêt tropicale [Termes IGN] image hyperspectrale [Termes IGN] image optique [Termes IGN] modèle de transfert radiatif [Termes IGN] réflectance végétale [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] transfert radiatif Index. décimale : THESE Thèses et HDR Résumé : (auteur) La préservation de la biodiversité est un enjeu majeur pour le développement durable. Face aux besoins de conservation à l’échelle globale, la définition des méthodes opérationnelles qui permettent d’évaluer la diversité biologique est nécessaire pour l’orientation des différentes politiques environnementales. La télédétection optique a montré un potentiel pour étudier la biodiversité. L’imagerie hyperspectrale aéroportée a été largement utilisée avec succès. Malgré son potentiel, l’imagerie hyperspectrale aéroportée ne permet pas de couvrir des vastes étendues (échelle régionale ou globale) suite à des contraintes logistique et financière. Les missions satellites hyperspectrales actuelles et futures (PRISMA, EnMAP, Biodiversity, CHIME, SBG…) offrent la possibilité d’étudier la biodiversité à grande échelle. Il existe cependant un besoin d’améliorer l’interprétation physique des méthodes existantes, basées sur les données aéroportées, pour évaluer leurs potentiels. Les outils de modélisation du transfert radiatif permettent de mieux comprendre l’interaction entre un rayonnement incident et les milieux physiques qu’ils traversent et de ce fait d’interpréter le signal. Ce projet de thèse vise à définir un cadre pour produire des simulations réalistes à l’aide du modèle de transfert radiatif 3D DART (Discrete Anisotropic Radiative Transfer) dans une perspective de soutien au développement méthodologique pour l'évaluation de la biodiversité et la préparation de futures missions satellites à l'aide de la modélisation 3D (adapté aux milieux complexes tels que les forêts tropicales). Pour ce faire, nous avons réalisé des études de sensibilité pour comprendre l’influence de deux facteurs sur la réflectance simulée par DART : la variabilité spatiale des propriétés optiques foliaires, la prise en compte des éléments non photosynthétiques de la végétation. Puis nous avons comparé ces simulations à des données hyperspectrales aéroportées expérimentales en décrivant les scènes forestières correspondantes de la manière la plus fine à l’aide d’information relatives à la structure, à la composition en espèces et à une sélection de traits fonctionnels foliaires. Plusieurs approches s’appuyant sur les propriétés optiques foliaires, et sur la prise en compte d’une fraction ligneuse ont été testées pour l’intégration des éléments non photosynthétique dans la scène. La variabilité spatiale des propriétés optiques foliaires a été testée en s’appuyant sur les données d’inventaires spatialisées, permettant de prendre en compte la variabilité à l’échelle du pixel, ou en opérant une uniformisation des propriétés optiques à l’échelle de la couronne de chaque individu, ou à l’échelle des espèces. Nos résultats ont montré que les simulations les plus proches des données expérimentales, jugées les plus réalistes, étaient obtenues par l’intégration des éléments non photosynthétiques par le biais d’une famille de constituants chimiques foliaires, les pigments bruns, combinée à une prise en compte de la variabilité des propriétés optiques à l’échelle du pixel. Les différences entre données expérimentales et simulations ont été étudiées en s’appuyant sur différents critères, comme la différence spectrale, la dissimilarité spectrale interspécifique et interspécifique et la capacité de discrimination spectrale des espèces. Nous avons obtenu une bonne concordance entre les simulations issues du scénario le plus réaliste et les données expérimentales. Note de contenu : Introduction générale 1- Télédétection optique appliquée au suivi de la biodiversité végétale dans les écosystèmes forestiers tropicaux 2- Le transfert radiatif dans la végétation et sa simulation 3- Données et méthodes 4- Résultats : simulation de la réflectance de canopée et analyse comparative 5- Discussion générale Conclusion générale et perspectives Numéro de notice : 28661 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/IMAGERIE Nature : Thèse française Note de thèse : Thèse de Doctorat : Géomatique : AgroParisTech : 2021 Organisme de stage : TETIS DOI : sans En ligne : https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03520758 Format de la ressource électronique : URL Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=99828

Consolidation of crowd-sourced geo-ragged data for parameterized travel recommendations / Ago Luberg (2021)  

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An overview of clustering methods for geo-referenced time series: from one-way clustering to co- and tri-clustering / Xiaojing Wu in International journal of geographical information science IJGIS, vol 34 n° 9 (September 2020)  

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Prediction of plant diversity in grasslands using Sentinel-1 and -2 satellite image time series / Mathieu Fauvel in Remote sensing of environment, Vol 237 (February 2020)  

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Application of digital image processing in automated analysis of insect leaf mines / Yee Man Theodora Cho (2020)  

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A learning approach to evaluate the quality of 3D city models / Oussama Ennafii in Photogrammetric Engineering & Remote Sensing, PERS, vol 85 n° 12 (December 2019)    

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“Mapping-with”: The Politics of (Counter-)classification in OpenStreetMap / Clancy Wilmott in Cartographic perspectives, n° 92 (2019)  

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De l’origine des Pins de montagne européens / Renaud Cantegrel in Revue forestière française [en ligne], vol 71 n° 3 (2019)  

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Ensemble methods for pedestrian detection in dense crowds / Jennifer Vandoni (2019)  

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Scalable evaluation of 3D city models / Oussama Ennafii (2019)  

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Semantic aware quality evaluation of 3D building models : Modeling and simulation / Oussama Ennafii (2019)  

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