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Termes IGN > sciences naturelles > sciences de la vie > médecine humaine > maladie infectieuse > épidémie
épidémie |
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Adapting an existing semi-automatized image processing chain to enable Sentinel-2 data classification. / Hiyam Elbadri (2018)
Titre : Adapting an existing semi-automatized image processing chain to enable Sentinel-2 data classification. Type de document : Mémoire Auteurs : Hiyam Elbadri, Auteur Editeur : Champs-sur-Marne : Ecole nationale des sciences géographiques ENSG Année de publication : 2018 Importance : 56 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : bibliographie
Rapport de projet pluridisciplinaire, cycle Ingénieur 2e annéeLangues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Applications de télédétection
[Termes IGN] analyse d'image orientée objet
[Termes IGN] carte thématique
[Termes IGN] chaîne de traitement
[Termes IGN] classification barycentrique
[Termes IGN] classification non dirigée
[Termes IGN] classification par forêts d'arbres décisionnels
[Termes IGN] classification par séparateurs à vaste marge
[Termes IGN] épidémie
[Termes IGN] GRASS
[Termes IGN] image Sentinel-MSI
[Termes IGN] maladie parasitaire
[Termes IGN] Ouganda
[Termes IGN] Python (langage de programmation)
[Termes IGN] R (langage)
[Termes IGN] restauration d'image
[Termes IGN] risque sanitaire
[Termes IGN] segmentation d'image
[Termes IGN] zone à risqueIndex. décimale : PROJET Mémoires : Rapports de projet - stage des ingénieurs de 2e année Résumé : (auteur) Dans un contexte d’une crise épidémiologique dans les villes d’Afrique sub-saharienne, suivie d’une urbanisation croissante, il paraît essentiel de souligner les facteurs clés au développement de plusieurs maladies. C’est dans ce contexte que le projet REACT existe. Ce dernier a pour but de développer des outils afin de faciliter l’étude des maladies contagieuses telle que la malaria avec des techniques de télédétection. Dans le cadre de ce projet, mon rôle était de créer une chaîne automatisée pour des données de Sentinel 2. En premier lieu, il faut les télécharger puis les pré-traiter pour enfin terminer avec une chaîne déjà existante que je devais adapter et qui permet la classification des données Sentinel 2. Les deux chaînes ont été implémentées via un programme Python et se fondent sur l’utilisation de logiciels libres tels que Grass GIS et R. Dans le cadre du projet, l’étude est appliquée à la ville de Kampala dans l’Ouganda, ville présentant les caractéristiques citées précédemment. Cartographier une zone hétérogène telle que Kampala en utilisant des techniques liées à l’"Object Based Image Analysis" est une méthode efficace pour améliorer notre compréhension de la maladie de la malaria et ce, dans un but d’avoir une meilleure prévisibilité. On obtiendra d’abord une segmentation optimale en utilisant une approche non supervisée. Ensuite, en utilisant une classification liée à cette maladie, nous allons classifier notre image en utilisant 3 classifieurs : SVM Radial, Random Forest et K-nearest Neighbor. S’en suivra une analyse de la précision obtenue pour ces 3 classifieurs. Les résultats seront interprétés de telle sorte qu’on pourra en déduire où se situent les zones à risque de la maladie dans la zone d’étude englobant la ville de Kampala et ses environs. Note de contenu : Introduction
1- Internship Description
2- Data, Methods and Tools
3- Case Study
4- Results
ConclusionNuméro de notice : 21826 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : IMAGERIE Nature : Mémoire de projet pluridisciplinaire Organisme de stage : IGEAT (Université Libre de Bruxelles) Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=91333 Documents numériques
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Adapting an existing semi-automatized... - pdf auteurAdobe Acrobat PDF Movement analysis of free-grazing domestic ducks in Poyang Lake, China: a disease connection / Dian J. Prosser in International journal of geographical information science IJGIS, vol 30 n° 5-6 (May - June 2016)
[article]
Titre : Movement analysis of free-grazing domestic ducks in Poyang Lake, China: a disease connection Type de document : Article/Communication Auteurs : Dian J. Prosser, Auteur ; Eric C. Palm, Auteur ; John Y. Takekawa, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2016 Article en page(s) : pp 869 - 880 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Analyse spatiale
[Termes IGN] Aves
[Termes IGN] Chine
[Termes IGN] élevage
[Termes IGN] épidémie
[Termes IGN] habitat animal
[Termes IGN] migration animale
[Termes IGN] surveillance sanitaireRésumé : (Auteur) Previous work suggests domestic poultry are important contributors to the emergence and transmission of highly pathogenic avian influenza throughout Asia. In Poyang Lake, China, domestic duck production cycles are synchronized with arrival and departure of thousands of migratory wild birds in the area. During these periods, high densities of juvenile domestic ducks are in close proximity to migratory wild ducks, increasing the potential for the virus to be transmitted and subsequently disseminated via migration. In this paper, we use GPS dataloggers and dynamic Brownian bridge models to describe movements and habitat use of free-grazing domestic ducks in the Poyang Lake basin and identify specific areas that may have the highest risk of H5N1 transmission between domestic and wild birds. Specifically, we determine relative use by free-grazing domestic ducks of natural wetlands, which are the most heavily used areas by migratory wild ducks, and of rice paddies, which provide habitat for resident wild ducks and lower densities of migratory wild ducks. To our knowledge, this is the first movement study on domestic ducks, and our data show potential for free-grazing domestic ducks from farms located near natural wetlands to come in contact with wild waterfowl, thereby increasing the risk for disease transmission. This study provides an example of the importance of movement ecology studies in understanding dynamics such as disease transmission on a complicated landscape. Numéro de notice : A2016-287 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1080/13658816.2015.1065496 En ligne : https://doi.org/10.1080/13658816.2015.1065496 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=80866
in International journal of geographical information science IJGIS > vol 30 n° 5-6 (May - June 2016) . - pp 869 - 880[article]Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 079-2016032 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible 079-2016031 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible CNES strategy: satellite data and modelling for public health: towards a cooperation with NASA / Murielle Lafaye in Geocarto international, vol 29 n° 5 - 6 (August - October 2014)
[article]
Titre : CNES strategy: satellite data and modelling for public health: towards a cooperation with NASA Type de document : Article/Communication Auteurs : Murielle Lafaye, Auteur ; Cécile Vignolles, Auteur ; John Haynes, Auteur ; Sue Estes, Auteur Année de publication : 2014 Article en page(s) : pp 663-670 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Applications de télédétection
[Termes IGN] coopération
[Termes IGN] épidémie
[Termes IGN] qualité de l'air
[Termes IGN] santéRésumé : (auteur) For ages, links between environment, climate and their impacts on human health have been observed and studied. Research to improve our understanding of environmental key determinants of infectious diseases can provide innovative information for adaptation strategies and lead to new tools optimizing surveillance, vector control measures, and disease prevention. As earth observation satellites can measure meteorological and environmental parameters, NASA and CNES have separately engaged in an innovative use of their earth observation infrastructure development programs: space tools addressing public health. As NASA and CNES have fruitful cooperation for satellite development missions for years, both health programs have proposed to explore a new area of collaboration: satellites addressing health issues. As members of international organizations, NASA and CNES could promote their common views towards the Group on Earth Observations (GEO) Community of Practice for Health & Environment and the Committee on Earth Observation Satellites (CEOS) Societal Benefit Area on Health. Numéro de notice : A2014-421 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1080/10106049.2013.827751 En ligne : http://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/10106049.2013.827751 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=73958
in Geocarto international > vol 29 n° 5 - 6 (August - October 2014) . - pp 663-670[article]Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 059-2014031 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible Cartes en mains contre Lili la tigresse / Françoise de Blomac in DécryptaGéo le mag, n° 152 (01/12/2013)
[article]
Titre : Cartes en mains contre Lili la tigresse Type de document : Article/Communication Auteurs : Françoise de Blomac, Auteur Année de publication : 2013 Article en page(s) : pp 16 - 17 Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Cartographie thématique
[Termes IGN] carte thématique
[Termes IGN] couche thématique
[Termes IGN] épidémie
[Termes IGN] Insecta
[Termes IGN] Languedoc-Roussillon
[Termes IGN] milieu urbain
[Termes IGN] occupation du sol
[Termes IGN] orthoimage
[Termes IGN] partition d'image
[Termes IGN] QGIS
[Termes IGN] risque sanitaire
[Termes IGN] vulnérabilitéRésumé : (Auteur) Même si le paludisme ne concerne plus que quelques zones en Guyane, le moustique tigre a pris pied dans la métropole et les épidémies de dengue et de chikungunya frappent durement certains territoires d'outre-mer. Enjeux économiques, de qualité de vie, de santé publique, mais également environnementaux doivent être pris en compte dans la lutte contre les moustiques. Dans le cadre du programme "lutte contre les moustiques nuisants et vecteurs", une extension Qgis permettant de connaître les risques liés au moustique tigre en milieu urbain a été développée par SIRS et le CIRAD. Numéro de notice : A2013-636 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article DOI : sans Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=32772
in DécryptaGéo le mag > n° 152 (01/12/2013) . - pp 16 - 17[article]Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 286-2013101 RAB Revue Centre de documentation En réserve L003 Disponible Spatial modeling of the black death in Sweden / Lars Skog in Transactions in GIS, vol 17 n° 4 (August 2013)
[article]
Titre : Spatial modeling of the black death in Sweden Type de document : Article/Communication Auteurs : Lars Skog, Auteur ; Hans Hauska, Auteur Année de publication : 2013 Article en page(s) : pp 589 - 611 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Applications SIG
[Termes IGN] analyse diachronique
[Termes IGN] analyse spatiale
[Termes IGN] carte thématique
[Termes IGN] épidémie
[Termes IGN] maladie infectieuse
[Termes IGN] modélisation spatiale
[Termes IGN] quatorzième siècle
[Termes IGN] santé
[Termes IGN] Suède
[Termes IGN] système d'information géographique
[Termes IGN] Web Map ServiceRésumé : (Auteur) The purpose of this work is to determine whether spatial modeling can be used to model the spread of the Black Death. The study is limited to models for the propagation of the disease in Sweden in 1350. Geographic data of Swedish water bodies and medieval road networks, historical data on the population in Swedish parishes, including their medieval boundaries, along with historical notes and disease characteristics, were used to build alternative models for spatial distribution. Three different models are presented: one radial, one cost-based and one combining network analysis and radial propagation. Simulations were made to depict different scenarios on the spread of the disease, as well as the drastic changes in the overall population of Sweden, over a couple of hundred years. For purpose of validation the population decrease estimated in each parish is compared with independent historical documents. Results from model scenarios are visualized in maps of propagation, animated video sequences and a web map service. Our analyses clearly demonstrate the power of spatial analysis and geographic information systems to describe, model and visualize epidemiologic processes in space and time. Numéro de notice : A2013-473 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1111/j.1467-9671.2012.01369.x Date de publication en ligne : 02/01/2013 En ligne : https://doi.org/10.1111/j.1467-9671.2012.01369.x Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=32611
in Transactions in GIS > vol 17 n° 4 (August 2013) . - pp 589 - 611[article]Spatial approaches to modeling dispersion of communicable diseases : A review / L. Bian in Transactions in GIS, vol 17 n° 1 (February 2013)PermalinkA longitudinal study of malaria associated with deforestation in Sonitpur district of Assam, India / M. Nath in Geocarto international, vol 27 n° 1 (February 2012)PermalinkSpatial patterns and eco-epidemiological systems – part 1: multi-scale spatial modelling of the occurrence of Chagas disease insect vectors / Emmanuel Roux in Geospatial Health, vol 6 n° 1 (November 2011)PermalinkSpatial patterns and eco-epidemiological systems – part 2: multi-scale spatial modelling of the occurrence of Chagas disease insect vectors / Emmanuel Roux in Geospatial Health, vol 6 n° 1 (November 2011)PermalinkResurgence of measles in the French military forces in 2010 / A. Mayet in European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, vol 30 n° 8 (August 2011)PermalinkGestion des risques de santé en milieu urbain : une orientation géostatistique et géospatiale d'un système multi-agents / Roland Ngom in Géomatique expert, n° 70 (01/09/2009)PermalinkRéalisation d'un modèle contingent à base d'agents pour simuler des épidémies de peste à Madagascar : le modèle SIMPEST / Dominique Badariotti in Revue internationale de géomatique, vol 19 n° 3 (septembre - novembre 2009)PermalinkPremière description d’une épidémie de dengue dans une commune de l’intérieur de la Guyane : Maripasoula, France, février 2006 / Jean-Baptiste Meynard in Bulletin épidémiologique hebdomadaire, vol 2008 n° 13 ([25/03/2008])PermalinkSpatial aspects of MRSA epidemiology: a case study using stochastic simulation, kernel estimation and SaTScan / Lucy Bastin in International journal of geographical information science IJGIS, vol 21 n° 6-7 (july 2007)PermalinkElaboration d'un modèle prédictif des risques de transmission paludique / Roland Ngom in Géomatique expert, n° 52 (01/09/2006)PermalinkApports de l'imagerie satellitaire à la mise à jour de l'information géographique dans les pays de la ceinture tropicale / J.L. Kouame (2006)PermalinkFirst evidence of West Nile virus amplification and relationship to human infections / C.N. Theophilides in International journal of geographical information science IJGIS, vol 20 n° 1 (january 2006)PermalinkMise en place d'un SIG à l'Institut Pasteur de la Guyane pour la surveillance des cas confirmés de dengue en Guyane / Xavier Thauvin (2006)PermalinkUtilisation d'un SIG en santé environnement / Anonyme in Géomatique expert, n° 47 (01/12/2005)PermalinkCombining usability techniques to design geovisualization tools for epidemiology / Antony C. Robinson in Cartography and Geographic Information Science, vol 32 n° 4 (October 2005)PermalinkMapping the SARS epidemic: interactive exploration and new approaches for understanding / Arnaud Banos in Geoinformatics, vol 8 n° 2 (01/03/2005)PermalinkApport de l'imagerie spatiale à la gestion des risques environnementaux, étude de cas / T. Dupuy (2005)PermalinkPrediction of anopheles minimus habitat in India: a tool for malaria management / Akhil Srivastava in International journal of geographical information science IJGIS, vol 19 n° 1 (january 2005)PermalinkLa mouche tsé-tsé sous haute surveillance : cartographie des paysages épidémiologiques de la maladie du sommeil par télédétection et analyse spatiale / D. Laffly in XYZ, n° 92 (septembre - novembre 2002)PermalinkSIG en pleine santé / Françoise de Blomac in SIG la lettre, n° 36 (avril 2002)Permalink