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Cartographie et caractérisation des lieux d'intérêt de cervidés en milieu forestier / Laurence Jolivet in Cartes & Géomatique, n° 247-248 (mars-juin 2022)

Public [article]  inCartes & Géomatique > n° 247-248 (mars-juin 2022) . - pp 47 - 59 Titre : Cartographie et caractérisation des lieux d'intérêt de cervidés en milieu forestier Type de document : Article/Communication Auteurs : Laurence Jolivet , Auteur ; Florian Masson, Auteur ; Sonia Saïd, Auteur Année de publication : 2022 Conférence : ICC 2021, 30th ICA international cartographic conference 14/12/2021 18/12/2021 Florence Italie Article en page(s) : pp 47 - 59 Note générale : Bibliographie Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Géomatique web [Termes IGN] analyse comparative [Termes IGN] Cervidae [Termes IGN] données spatiotemporelles [Termes IGN] espèce végétale [Termes IGN] faune locale [Termes IGN] forêt tempérée [Termes IGN] gestion forestière [Termes IGN] jeu de données localisées [Termes IGN] migration animale [Termes IGN] parcelle forestière [Termes IGN] positionnement par GPS [Termes IGN] Vosges (88) Résumé : (Auteur) La faune influence son environnement spatial et cet environnement influence en retour l'utilisation de l'espace par la faune. En gestion forestière, il est nécessaire de protéger les parcelles sensibles à la pression des animaux. Notre objectif est de proposer des cartes pertinentes pour la gestion, contenant les déplacements individuels et les espaces utilisés selon les espèces animales, ainsi que leur contexte spatio-temporel. Le cas d'étude concerne deux espèces, le chevreuil et le cerf, dans un site en milieu forestier au nord-est de la France. Les déplacements de plusieurs individus ont été analysés à partir de localisations GPS. Les lieux d'intérêt pour la recherche de nourriture supposés correspondre à des comportements de recherche intensive ont été calculés par la Méthode du temps de Premier Passage. Ces lieux ont ensuite été caractérisés avec les éléments du paysage et des indications de temporalité. Des cartes ont été réalisées afin de visualiser les informations disponibles sur ces lieux d'intérêt, en définissant des symbolisations adaptées. Des cartes ont aussi été réalisées par rapport à l'espace fonctionnel comprenant des parcelles favorables ou évitées issues de la comparaison entre espace parcouru et espace disponible. Ces parcelles sont qualifiées selon un gradient d'intérêt potentiel par espèce animale. Le processus cartographique a été effectué afin d'obtenir des cartes adaptées à l'affichage dans un portail géographique numérique et à la lecture par des utilisateurs impliqués en gestion forestière et en aménagement. Numéro de notice : A2022-675 Affiliation des auteurs : UGE-LASTIG+Ext (2020- ) Thématique : FORET/GEOMATIQUE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueNat DOI : sans Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=101889 [article]

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Role of maximum entropy and citizen science to study habitat suitability of jacobin cuckoo in different climate change scenarios / Priyinka Singh in ISPRS International journal of geo-information, vol 10 n° 7 (July 2021)  

Public [article]  inISPRS International journal of geo-information > vol 10 n° 7 (July 2021) . - n° 463 Titre : Role of maximum entropy and citizen science to study habitat suitability of jacobin cuckoo in different climate change scenarios Type de document : Article/Communication Auteurs : Priyinka Singh, Auteur ; Sameer Saran, Auteur ; Sultan Kocaman, Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : n° 463 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Analyse spatiale [Termes IGN] apprentissage automatique [Termes IGN] Aves [Termes IGN] changement climatique [Termes IGN] distribution spatiale [Termes IGN] données spatiotemporelles [Termes IGN] entropie maximale [Termes IGN] habitat animal [Termes IGN] migration animale [Termes IGN] mousson [Termes IGN] science citoyenne Résumé : (auteur) Recent advancements in spatial modelling and mapping methods have opened up new horizons for monitoring the migration of bird species, which have been altered due to the climate change. The rise of citizen science has also aided the spatiotemporal data collection with associated attributes. The biodiversity data from citizen observatories can be employed in machine learning algorithms for predicting suitable environmental conditions for species’ survival and their future migration behaviours. In this study, different environmental variables effective in birds’ migrations were analysed, and their habitat suitability was assessed for future understanding of their responses in different climate change scenarios. The Jacobin cuckoo (Clamator jacobinus) was selected as the subject species, since their arrival to India has been traditionally considered as a sign for the start of the Indian monsoon season. For suitability predictions in current and future scenarios, maximum entropy (Maxent) modelling was carried out with environmental variables and species occurrences observed in India and Africa. For modelling, the correlation test was performed on the environmental variables (bioclimatic, precipitation, minimum temperature, maximum temperature, precipitation, wind and elevation). The results showed that precipitation-related variables played a significant role in suitability, and through reclassified habitat suitability maps, it was observed that the suitable areas of India and Africa might decrease in future climatic scenarios (SSPs 2.6, 4.5, 7.0 and 8.5) of 2030 and 2050. In addition, the suitability and unsuitability areas were calculated (in km2) to observe the subtle changes in the ecosystem. Such climate change studies can support biodiversity research and improve the agricultural economy. Numéro de notice : A2021-545 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/GEOMATIQUE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.3390/ijgi10070463 Date de publication en ligne : 06/07/2021 En ligne : https://doi.org/10.3390/ijgi10070463 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=98046 [article]

Interactions between oak and cervids during the process of forest regeneration / Julien Barrere (2021)  

Public Titre : Interactions between oak and cervids during the process of forest regeneration : the case study of plain temperate oak stands (Quercus robur et Q. petraea) Type de document : Thèse/HDR Auteurs : Julien Barrere, Auteur ; Sonia Saïd, Directeur de thèse ; Catherine Collet, Directeur de thèse Editeur : Nancy, Metz : Université de Lorraine Année de publication : 2021 Importance : 315 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : Bibliographie Thèse pour obtenir le grade de Docteur de L'Université d'Orléans, Spécialité Biologie et écologie des forêts et des agrosystèmes Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] analyse spatio-temporelle [Termes IGN] canopée [Termes IGN] Cervidae [Termes IGN] données spatiotemporelles [Termes IGN] écosystème forestier [Termes IGN] faune locale [Termes IGN] forêt tempérée [Termes IGN] inventaire forestier local [Termes IGN] migration animale [Termes IGN] peuplement forestier [Termes IGN] Quercus pedunculata [Termes IGN] Quercus sessiliflora [Termes IGN] régénération (sylviculture) [Termes IGN] Suède [Termes IGN] Vosges, massif des [Vedettes matières IGN] Foresterie Index. décimale : THESE Thèses et HDR Résumé : (Auteur) Les cervidés ont vu leur abondance et leur distribution spatiale augmenter fortement depuis les dernières décennies, en France, et plus généralement à l’échelle de l’hémisphère Nord. Si ces espèces jouent un rôle clé dans le fonctionnement des écosystèmes forestiers, le niveau actuel des populations compromet le processus de régénération forestière de certaines essences cruciales pour la filière sylvicole telles que les chênes sessile et pédonculé (Quercus robur et Q. petraea). L’objectif de cette thèse est de quantifier et décrire les mécanismes sous-jacent de la contrainte exercée par les cervidés sur la régénération et d’identifier dans quelle mesure certaines opérations sylvicoles (coupe, dégagement et pose d’enclos) influencent cette contrainte. L’analyse de la composition de panses de cerf et de chevreuil sur le site de La Petite Pierre (Vosges) a permis de montrer que les glands de chêne représentaient une ressource significative dans le régime alimentaire de ces deux espèces, mais que leur consommation de gland saturait les années de forte fructification. Par des approches expérimentales, nous avons mis en évidence que l’abroutissement de la pousse apicale réduisait toujours la croissance en hauteur des semis que ce soit en condition de terrain, ou en pépinière, et que ce phénomène s’expliquait par une faible plasticité d’allocation des ressources pour compenser la perte de tissu. L’analyse d’un résultat d’un réseau d’enclos-exclos répartis sur plusieurs sites en France et en Suède a permis de montrer que la coupe d’arbre adulte pour augmenter l’ouverture de la canopée accentuait l’effet négatif des cervidés sur la croissance et la survie de jeunes semis de chêne, via une plus forte fréquentation des cervidés dans les patches de régénération ouverts. Enfin, suite à l’implémentant du processus d’herbivorie dans un modèle de dynamique forestière (bibliothèque Régénération de CAPSIS), j’ai effectué des simulations suggérant que sous une forte pression d’herbivorie, des opérations de dégagement moins fréquentes et maintenant des espèces accompagnatrices appétentes comme le charme permettrait de réduire l’influence négative des cervidés sur la croissance du chêne. En conclusion, les résultats de cette thèse étayent l’hypothèse que les cervidés représentent une contrainte significative pour le processus de régénération du chêne, mais suggère qu’une gestion de la végétation de sous-bois adaptée permettrait de réduire cette contrainte et de se rapprocher d’un équilibre plus durable entre faune sauvage et activités sylvicoles. Note de contenu : CHAPTER 1 - Introduction 1.1 The anthropic origin of an imbalance between forest trees and wildlife 1.2 Managing the balance between forests and large herbivores 1.3 Presentation of the studied species and their specificity 1.4 On the drivers and constraints of oak regeneration 1.5 Interactions between oak and cervids throughout the regeneration process, and remaining knowledge gaps 1.6 Objective of the thesis and structure of the manuscript CHAPTER 2 - Scientific Approaches 2.1 Observational data for the study of spatial and temporal patterns 2.2 Experimental approaches to studying forest-deer interactions 2.3 An in silico approach to synthesize multiple data sources 2.4 Conclusion CHAPTER 3 - How does oak mast seeding affect the feeding behaviour of sympatric red and roe deer ? 3.1 Abstract 3.2 Introduction 3.3 Materials and methods 3.4 Results 3.5 Discussion 3.6 Conclusion 3.7 Acknowledgments 3.8 Appendices CHAPTER 4 - Do trait responses to simulated browsing in Quercus robur saplings affect their attractiveness to Capreolus capreolus the following year? 4.1 Abstract 4.2 Introduction 4.3 Material and methods 4.4 Results 4.5 Discussion 4.6 Conclusions 4.7 Funding 4.8 Authorship 4.9 Acknowledgments 4.10 Appendices CHAPTER 5 - Oak responses to browsing in field conditions 5.1 Context and objective 5.2 Overview of the methodology 5.3 Results 5.4 Conclusion CHAPTER 6 - Canopy openness and exclusion of wild ungulates act synergistically to improve oak natural regeneration 6.1 Abstract 6.2 Introduction 6.3 Material and methods 6.4 Results 6.5 Discussion 6.6 Conclusion 6.7 Acknowledgments 6.8 Appendices CHAPTER 7 - The influence of deer browsing on oak regeneration is conditioned by the shrub layer - insights from a modeling approach 7.1 Preamble 7.2 Introduction 7.3 Including deer browsing in the CAPSIS regeneration library 7.4 A first set of simulations 7.5 Perspectives and conclusion CHAPTER 8 - Discussion and perspectives 8.1 Overview of the results 8.2 Perspectives 8.3 General conclusion CHAPTER 9 - Résumé de la thèse en Français 9.1 Introduction 9.2 Influence du masting du chêne sur le comportement alimentaire du cerf et du chevreuil 9.3 Réponse des jeunes chênes à l’abroutissement, et conséquence pour l’attractivité du plant 9.4 Influence croisée de l’ouverture de la canopée et de l’exclusion des ongulés sauvages sur la régénération du chêne 9.5 L’influence de l’abroutissement sur la régénération du chêne est conditionné par la végétation accompagnatrice 9.6 Synthèse et perspectives Numéro de notice : 26952 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Thèse française Note de thèse : Thèse de Doctorat : Biologie et écologie des forêts et des agrosystèmes : Lorraine : 2021 Organisme de stage : Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement INRAE DOI : sans Date de publication en ligne : 11/01/2023 En ligne : https://hal.univ-lorraine.fr/tel-03702537v1/document Format de la ressource électronique : URL Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=102436

Mapping and characterizing animals’ places of interest in forest environment / Laurence Jolivet (2021)  

Public Titre : Mapping and characterizing animals’ places of interest in forest environment Type de document : Article/Communication Auteurs : Laurence Jolivet , Auteur ; Florian Masson, Auteur ; Sonia Saïd, Auteur Editeur : International Cartographic Association ICA - Association cartographique internationale ACI Année de publication : 2021 Collection : Proceedings of the ICA num. 4 Projets : 1-Pas de projet / Conférence : ICC 2021, 30th ICA international cartographic conference 14/12/2021 18/12/2021 Florence Italie Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Cartographie thématique [Termes IGN] Cervidae [Termes IGN] comportement [Termes IGN] coordonnées GPS [Termes IGN] forêt tempérée [Termes IGN] migration animale [Termes IGN] réserve naturelle [Termes IGN] Vosges, massif des Mots-clés libres : première heure de passage = first passage time  foraging place = lieu de nourriture  functional space = espace fonctionnel Résumé : (auteur) Fauna impacts its environment as well as spatial environment influences fauna space use. Forest management implies taking into account pressure from animals in fragile-balanced patches. Our goal is to propose maps that would benefit forest planning by reflecting individual movement and space use depending on the animal species and local spatiotemporal environment. The study case focuses on two species, roe deer and red deer, and on a forested site in the northeast of France. Movements of several individuals were analysed from collected GPS locations. Foraging places likely to correspond to intense research behaviour were computed using the First-Passage Time method. These places were assumed as being of interest and were characterized with landscape features and temporal information. Maps were produced to synthetize information about foraging places by defining adapted symbolizations. Then maps about functional space were proposed based on extrapolation of favourable or avoided areas from the characterized observed foraging places and space use. Landscape patches were mapped according to a gradient of potential interest by animals’ species, in order to highlight needs of specific planning actions in the forestry context. Map displays were driven by forestry end-use and designed so that to be compliant to a numeric geographical portal, giving access to different available on-line layers and computed created ones. Numéro de notice : C2021-060 Affiliation des auteurs : UGE-LASTIG+Ext (2020- ) Thématique : BIODIVERSITE/GEOMATIQUE Nature : Communication nature-HAL : ComAvecCL&ActesPubliésIntl DOI : 10.5194/ica-proc-4-51-2021 Date de publication en ligne : 03/12/2021 En ligne : https://doi.org/10.5194/ica-proc-4-51-2021 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=99390

Group diagrams for representing trajectories / Maike Buchin in International journal of geographical information science IJGIS, vol 34 n° 12 (December 2020)  

Public [article]  inInternational journal of geographical information science IJGIS > vol 34 n° 12 (December 2020) . - pp 2401 - 2433 Titre : Group diagrams for representing trajectories Type de document : Article/Communication Auteurs : Maike Buchin, Auteur ; Bernhard Kilgus, Auteur ; Andrea Kölzsch, Auteur Année de publication : 2020 Article en page(s) : pp 2401 - 2433 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Analyse spatiale [Termes IGN] analyse de groupement [Termes IGN] analyse spatio-temporelle [Termes IGN] approximation [Termes IGN] base de données d'objets mobiles [Termes IGN] diagramme [Termes IGN] distance de Fréchet [Termes IGN] données GPS [Termes IGN] géomètrie algorithmique [Termes IGN] itinéraire [Termes IGN] migration animale [Termes IGN] objet mobile Résumé : (auteur) Given the trajectories of one or several moving groups, we propose a new framework, the group diagram (GD) for representing these. Specifically, we seek a minimal GD as a concise representation of the groups maintaining the spatio-temporal structure of the groups’ movement. A GD is specified by three input values, namely a distance threshold, a similarity measure and a minimality criterion. For several variants of the GD, we give a comprehensive analysis of their computational complexity and present efficient approximation algorithms for their computation. Furthermore, we experimentally evaluate our algorithms on GPS data of migrating geese. Applying the proposed methods on these data sets reveals how the GD concisely represents the movement of the groups. This representation can be used for further analysis and for the formulation of new hypotheses for further ecological research, such as differences in movement patterns of groups on different surfaces or the shift of migration routes over several years. We use different similarity measures to summarize the migration routes of (i) a goose family for one migration period and to summarize (ii) the migration routes of one individual for several migration periods or (iii) the migration routes of several independent individuals for one migration period. Numéro de notice : A2020-690 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : GEOMATIQUE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1080/13658816.2019.1684498 Date de publication en ligne : 25/11/2019 En ligne : https://doi.org/10.1080/13658816.2019.1684498 Format de la ressource électronique : url article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96227 [article]

Incorporating behavior into animal movement modeling: a constrained agent-based model for estimating visit probabilities in space-time prisms / Rebecca W. Loraamm in International journal of geographical information science IJGIS, vol 34 n° 8 (August 2020)  

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Mapping areas of asynchronous‐temporal interaction in animal‐telemetry data / Brendan A. Hoover in Transactions in GIS, Vol 24 n° 3 (June 2020)  

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The influence of sampling design on spatial data quality in a geographic citizen science project / Greg Brown in Transactions in GIS, Vol 23 n° 6 (November 2019)  

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A time‐geographic approach to quantifying wildlife–road interactions / Rebecca W. Loraamm in Transactions in GIS, vol 23 n° 1 (February 2019)  

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Visual exploration of migration patterns in gull data / Maximilian Konzack in Information visualization, vol 18 n° 1 (January 2019)  

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Testing time-geographic density estimation for home range analysis using an agent-based model of animal movement / Joni A. Downs in International journal of geographical information science IJGIS, vol 32 n° 7-8 (July - August 2018)  

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Fragmentation linéaire, restauration d’une continuité écologique / Marie-Lou Lamy (2018) 

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Trame verte et bleue : bilan des besoins, enjeux et actions de connaissance identifiés par les Schémas régionaux de cohérence écologique / Romain Sordello in Naturae, n° 10 ([26/07/2017])    

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Decentralized detection and monitoring of convoy patterns / Jeremy Yeoman in International journal of geographical information science IJGIS, vol 30 n° 5-6 (May - June 2016)  

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Movement analysis of free-grazing domestic ducks in Poyang Lake, China: a disease connection / Dian J. Prosser in International journal of geographical information science IJGIS, vol 30 n° 5-6 (May - June 2016)  

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