Centre dedocumentation
scientifique

Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) of wood reveals distinct chemical signatures of two species of Afzelia / Peter Kitin in Annals of Forest Science [en ligne], vol 78 n° 2 (June 2021)  

Public [article]  inAnnals of Forest Science [en ligne] > vol 78 n° 2 (June 2021) . - Article 31 Titre : Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) of wood reveals distinct chemical signatures of two species of Afzelia Type de document : Article/Communication Auteurs : Peter Kitin, Auteur ; Edgard Espinoza, Auteur ; Hans Beeckman, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2021 Article en page(s) : Article 31 Note générale : Bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Traitement d'image [Termes IGN] abattage (sylviculture) [Termes IGN] Afzelia (genre) [Termes IGN] analyse discriminante [Termes IGN] apprentissage non-dirigé [Termes IGN] bois [Termes IGN] espèce végétale [Termes IGN] forêt tropicale [Termes IGN] identification de plantes [Termes IGN] signature spectrale [Termes IGN] spectrométrie [Termes IGN] taxinomie [Termes IGN] temps réel Résumé : (Auteur) Distinct chemical fingerprints of the wood of Afzelia pachyloba and A. bipindensis demonstrated an effective method for identifying these two commercially important species. Direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) allowed high-throughput examination of chemotypes with vast potential in taxonomic, ecological, and forensic research of wood. Context : Afzelia is a genus of valuable tropical timber trees. Accurate identification of wood is required for the prevention of illicit timber trade as well as for certification purposes in the forest and wood products industry. For many years, particular interest has been focused on attempts to distinguish the wood of A. bipindensis Harms from A. pachyloba Harms due to substantial differences in the commercial values of these two species. Aims : We investigated if wood chemical signatures and microscopy could identify the wood of A. bipindensis and A. pachyloba. Methods : We used two approaches, namely metabolome profiling by direct analysis in real-time (DART) time-of-flight mass spectrometry (TOFMS) and wood microstructure by light microscopy and SEM. In all, we analyzed samples from 89 trees of A. bipindensis, and A. pachyloba. Results : The two species could not be separated by the IAWA standard microscopic wood features. SEM analysis showed considerable variation in the morphology of vestured pits; however, this variation was not species-specific. In contrast, DART-TOFMS followed by unsupervised statistics (Discriminant Analysis of Principal Components) showed distinct metabolome signatures of the two species. Conclusion : DART-TOFMS provides a rapid method for wood identification that can be easily applied to small heartwood samples. Time- and cost-effective classification of wood chemotypes by DART-TOFMS can have potential applications in various research questions in forestry, wood science, tree-ecophysiology, and forensics. Numéro de notice : A2021-327 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1007/s13595-020-01024-1 date de publication en ligne : 31/03/2021 En ligne : https://doi.org/10.1007/s13595-020-01024-1 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=97488 [article]

Economic losses caused by tree species proportions and site type errors in forest management planning / Arto Haara in Silva fennica, vol 53 n° 2 (2019)  

Public [article]  inSilva fennica > vol 53 n° 2 (2019) Titre : Economic losses caused by tree species proportions and site type errors in forest management planning Type de document : Article/Communication Auteurs : Arto Haara, Auteur ; Annika S. Kangas, Auteur ; Sakari Tuominen, Auteur Année de publication : 2019 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] coupe (sylviculture) [Termes IGN] données lidar [Termes IGN] données localisées 3D [Termes IGN] éclaircie (sylviculture) [Termes IGN] erreur [Termes IGN] Finlande [Termes IGN] identification de plantes [Termes IGN] image 3D [Termes IGN] image aérienne [Termes IGN] image spatiale [Termes IGN] incertitude des données [Termes IGN] inventaire forestier étranger (données) [Vedettes matières IGN] Economie forestière Résumé : (auteur) The aim of this study was to estimate economic losses, which are caused by forest inventory errors of tree species proportions and site types. Our study data consisted of ground truth data and four sets of erroneous tree species proportions. They reflect the accuracy of tree species proportions in four remote sensing data sets, namely 1) airborne laser scanning (ALS) with 2D aerial image, 2) 2D aerial image, 3) 3D and 2D aerial image data together and 4) satellite data. Furthermore, our study data consisted of one simulated site type data set. We used the erroneous tree species proportions to optimise the timing of forest harvests and compared that to the true optimum obtained with ground truth data. According to the results, the mean losses of Net Present Value (NPV) because of erroneous tree species proportions at an interest rate of 3% varied from 124.4 € ha–1 to 167.7 € ha–1. The smallest losses were observed using tree species proportions predicted using ALS data and largest using satellite data. In those stands, respectively, in which tree species proportion errors actually caused economic losses, they were 468 € ha–1 on average with tree species proportions based on ALS data. In turn, site type errors caused only small losses. Based on this study, accurate tree species identification seems to be very important with respect to operational forest inventory. Numéro de notice : A2019-378 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET Nature : Article DOI : 10.14214/sf.10089 date de publication en ligne : 17/06/2019 En ligne : https://doi.org/10.14214/sf.10089 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=93444 [article]

Individual tree crown delineation in a highly diverse tropical forest using very high resolution satellite images / Fabien Hubert Wagner in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 145 - part B (November 2018)  

Public [article]  inISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing > vol 145 - part B (November 2018) . - pp 362 - 377 Titre : Individual tree crown delineation in a highly diverse tropical forest using very high resolution satellite images Type de document : Article/Communication Auteurs : Fabien Hubert Wagner, Auteur ; Matheus Pinheiro Ferreira, Auteur ; Alber Sanchez, Auteur ; et al., Auteur Année de publication : 2018 Article en page(s) : pp 362 - 377 Note générale : bibliographie Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Traitement d'image optique [Termes IGN] Brésil [Termes IGN] détection de contours [Termes IGN] forêt tropicale [Termes IGN] houppier [Termes IGN] identification de plantes [Termes IGN] image multibande [Termes IGN] image Worldview [Termes IGN] morphologie mathématique [Termes IGN] segmentation d'image Résumé : (auteur) Mapping tropical tree species at landscape scales to provide information for ecologists and forest managers is a new challenge for the remote sensing community. For this purpose, detection and delineation of individual tree crowns (ITCs) is a prerequisite. Here, we present a new method of automatic tree crown delineation based only on very high resolution images from WorldView-2 satellite and apply it to a region of the Atlantic rain forest with highly heterogeneous tropical canopy cover – the Santa Genebra forest reserve in Brazil. The method works in successive steps that involve pre-processing, selection of forested pixels, enhancement of borders, detection of pixels in the crown borders, correction of shade in large trees and, finally, segmentation of the tree crowns. Principally, the method uses four techniques: rolling ball algorithm and mathematical morphological operations to enhance the crown borders and ease the extraction of tree crowns; bimodal distribution parameters estimations to identify the shaded pixels in the gaps, borders, and crowns; and focal statistics for the analysis of neighbouring pixels. Crown detection is validated by comparing the delineated ITCs with a sample of ITCs delineated manually by visual interpretation. In addition, to test if the spectra of individual species are conserved in the automatic delineated crowns, we compare the accuracy of species prediction with automatic and manual delineated crowns with known species. We find that our method permits detection of up to 80% of ITCs. The seven species with over 10 crowns identified in the field were mapped with reasonable accuracy (30.5–96%) given that only WorldView-2 bands and texture features were used. Similar classification accuracies were obtained using both automatic and manual delineation, thereby confirming that species’ spectral responses are preserved in the automatic method and thus permitting the recognition of species at the landscape scale. Our method might support tropical forest applications, such as mapping species and canopy characteristics at the landscape scale. Numéro de notice : A2018-536 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : FORET/IMAGERIE Nature : Article nature-HAL : ArtAvecCL-RevueIntern DOI : 10.1016/j.isprsjprs.2018.09.013 date de publication en ligne : 08/10/2018 En ligne : https://doi.org/10.1016/j.isprsjprs.2018.09.013 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=91541 [article]

Réservation

Réserver ce document

Exemplaires (3)

Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
081-2018121	RAB	Revue	Centre de documentation	En réserve 3L	Disponible
081-2018123	DEP-EXM	Revue	LaSTIG	Dépôt en unité	Exclu du prêt
081-2018122	DEP-EAF	Revue	Nancy	Dépôt en unité	Exclu du prêt

L'Atelier botanique des Barres : une expérience d'herborisation participative dans l'est du département du Loiret / Richard Chevalier in Symbioses, bulletin des muséums d'histoire naturelle de la région Centre, n° 35 - 36 ([01/09/2018])

Public [article]  inSymbioses, bulletin des muséums d'histoire naturelle de la région Centre > n° 35 - 36 [01/09/2018] . - pp Titre : L'Atelier botanique des Barres : une expérience d'herborisation participative dans l'est du département du Loiret Type de document : Article/Communication Auteurs : Richard Chevalier, Auteur ; Marine Dalmasso , Auteur ; Gérard Dumé, Auteur ; L. Léquivard, Auteur ; Hilaire Martin, Auteur ; N. Perrette, Auteur ; J.C. Tandy, Auteur ; Anne Villemey, Auteur Année de publication : 2018 Article en page(s) : pp Langues : Français (fre) Descripteur : [Termes IGN] formation continue [Termes IGN] identification de plantes [Termes IGN] Loiret (45) [Vedettes matières IGN] Botanique Résumé : (auteur) Depuis 2008, chaque lundi, de 12 h à 14 h, les personnels du domaine des Barres (Irstea, IGN, Legta, ONF-Arboretum) se retrouvent pour participer à l'Atelier botanique des Barres (ABB). Prévu pour s'initier et se perfectionner à l'identification de la flore, ce rendez-vous hebdomadaire relève à la fois de la découverte de la nature, de la formation continue, des sciences participatives et de l'entretien des bonnes relations entre organismes d'un même campus. Botanistes professionnels ou d'un jour, chefs ou simples opérateurs, permanents ou temporaires, tout le monde se retrouve sous le soleil ou la pluie mais toujours dans la bonne humeur pour aller herboriser sur les communes environnantes. Au bout de huit années de fonctionnement, à raison de six ou sept en moyenne par séance, ce sont 160 personnes qui ont participé à l'ABB, prospecté 94 communes, identifié 1 085 espèces et transmis 30 700 données pour alimenter la base de données Flora du Conservatoire botanique national du Bassin parisien. Cependant, l'ABB a aujourd'hui besoin d'être redynamisé pour perdurer. Numéro de notice : A2018-679 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2012-2019) Thématique : FORET Nature : Article nature-HAL : ArtSansCL DOI : sans Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96411 [article]

Bryophytes sl. : Mousses, hépatiques et anthocérotes : Glossaire illustré / Leica Chavoutier (2016) 

Public Titre : Bryophytes sl. : Mousses, hépatiques et anthocérotes : Glossaire illustré Titre original : Bryophytes sl. : Mosses, liverworts and hornworts : Illustrated glossary Type de document : Guide/Manuel Auteurs : Leica Chavoutier, Auteur Editeur : chez l'auteur Année de publication : 2016 Importance : 182 p. Note générale : Bibliographie Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Végétation [Termes IGN] Bryophyta (mousses) [Termes IGN] Bryophyte [Termes IGN] identification de plantes Résumé : (auteur) [introduction] Ce glossaire traite des mousses, hépatiques et anthocérotes, trois phylums proches par certaines parties de leurs structures et surtout par leur cycle de vie qui sont actuellement regroupés pour former les Bryophytes sl. Ce glossaire se veut une aide à la reconnaissance des termes courants utilisés en bryologie mais aussi un complément donné à tous les utilisateurs des flores et autres publications rédigées en anglais qui ne maîtrisent pas parfaitement la langue et qui sont vite confrontés à des interprétations douteuses en consultant l’habituel dictionnaire bilingue. Il se veut pratique d’utilisation et pour ce fait est largement illustré. Note de contenu : Introduction Planches Glossaire : français/English Glossary : English/français Index des photographies Numéro de notice : 17395 Affiliation des auteurs : non IGN Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Guide Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=85103

Documents numériques

en open access Bryophytes sl. glossaire illustré Adobe Acrobat PDF

Robust hyperspectral vision-based classification for multi-season weed mapping / Y. Zhang in ISPRS Journal of photogrammetry and remote sensing, vol 69 (April 2012)

Permalink

Guide des plantes à fleurs, des arbres et des arbustes d'Europe occidentale / David Mac Clintock (2005)

Permalink

Suivi de la composition floristique des placettes du réseau (1994/1995-2000) et élaboration d'un programme d'assurance qualité intensif / Sylvaine Camaret (2004) 

Permalink

Reconnaître les bois de nos résineux... in Forêts de France, n° 417 (octobre 1998)

Permalink

Flore de France / Marcel Guinochet (1982)

Permalink

Les quatre flores de la France, Corse comprise (générale, alpine, méditerranéenne, littorale) / Paul Fournier (1977)

Permalink

Flore du Cameroun, les botanistes au Cameroun / R. Letouzey (1968)

Permalink

Flore du Sénégal / J. Berhaut (1967)

Permalink

Flore complète portative de la France et de la Suisse, comprenant aussi les espèces de Belgique pour trouver facilement le nom des plantes, sans mots techniques / Gaston Bonnier (ca : 1930)  

Permalink

Les plantes des champs et des bois, excursions botaniques. Printemps, été, automne, hiver / Gaston Bonnier (ca : 1930)  

Permalink