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Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE
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Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, un institut EPST issu de la fusion de l’Inra et d’Irstea au 1er janv 2020.
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Titre : Genome-wide evolutionary response of European oaks since the Little Ice Age Type de document : Article/Communication Auteurs : Dounia Saleh, Auteur ; Jun Chen, Auteur ; Jean-Charles Leple, Auteur ; Thibault Leroy, Auteur ; Laura Truffaut, Auteur ; Benjamin Dencausse, Auteur ; et al., Auteur ; François Morneau , Auteur
Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE Année de publication : 2021 Projets : 3-projet - voir note / Importance : 35 p. Note générale : bibliographie
This research was supported by the European Research Council through an Advanced Grant (project TREEPEACE # FP7-339728), by France Génomique (project EVOL-OAK, ANR-10-INBS-09–08), and by the French Forest Service (ONF) (INRAE-ONF TREEPEACE contract).Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] dix-huitième siècle
[Termes IGN] dix-neuvième siècle
[Termes IGN] dix-septième siècle
[Termes IGN] France (géographie physique)
[Termes IGN] génétique forestière
[Termes IGN] Quercus sessiliflora
[Termes IGN] quinzième siècle
[Termes IGN] seizième siècle
[Vedettes matières IGN] BotaniqueRésumé : (auteur) The pace of tree microevolution during Anthropocene warming is largely unknown. We used a retrospective approach to monitor genomic changes in oak trees since the Little Ice Age (LIA). Allelic frequency changes were assessed from whole-genome pooled sequences for four age-structured cohorts of sessile oak (Quercus petraea) dating back to 1680, in each of three different oak forests in France. The genetic covariances of allelic frequency changes increased between successive time periods, highlighting genome-wide effects of linked selection. We found imprints of convergent linked selection in the three forests during the late LIA, and a shift of selection during more recent time periods. The changes in allelic covariances within and between forests mirrored the documented changes in the occurrence of extreme events (droughts and frosts) over the last three hundred years. The genomic regions with the highest covariances were enriched in genes involved in plant responses to pathogens and abiotic stresses (temperature and drought). These responses are consistent with the reported sequence of frost (or drought) and disease damage ultimately leading to the oak dieback after extreme events. Our results therefore provide evidence of selection operating on long-lived species during recent climatic changes. Numéro de notice : P2021-004 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2020- ) Thématique : FORET Nature : Preprint nature-HAL : Préprint DOI : 10.1101/2021.05.25.445558 Date de publication en ligne : 27/05/2021 En ligne : https://doi.org/10.1101/2021.05.25.445558 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=97846 Adaptation de la sylviculture du pin laricio en France dans le contexte de la maladie des bandes rouges : Quels sont les déterminants de la vulnérabilité du pin laricio à la maladie des bandes rouges ? / Sandrine Perret (2019)
Titre : Adaptation de la sylviculture du pin laricio en France dans le contexte de la maladie des bandes rouges : Quels sont les déterminants de la vulnérabilité du pin laricio à la maladie des bandes rouges ? : Rapport final Type de document : Rapport Auteurs : Sandrine Perret, Auteur ; Océane Audin, Auteur ; Dominique Balay, Auteur ; Michel Chartier, Auteur ; Camille Couteau, Auteur ; Sébastien Daviller, Auteur ; Gilbert Douzon, Auteur ; Bruno Fady, Auteur ; Christian Ginisty, Auteur ; Stéphane Matz, Auteur ; Céline Meredieu, Auteur ; Thomas Pérot, Auteur ; Gwenaël Philippe, Auteur ; Jérôme Rosa, Auteur ; François-Xavier Saintonge, Auteur ; Marc Saudreau, Auteur ; Caroline Scotti-Saintagne, Auteur ; Laurent Severin, Auteur ; Eric Sevrin, Auteur ; Ingrid Seynave, Auteur ; Charles Tessier, Auteur ; Pascal Walser, Auteur ; Stéphanie Wurpillot Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE Année de publication : 2019 Importance : 144 p. Langues : Français (fre) Descripteur : [Termes IGN] croissance des arbres
[Termes IGN] densité du peuplement
[Termes IGN] maladie phytosanitaire
[Termes IGN] Pinus nigra corsicana
[Vedettes matières IGN] ForesterieRésumé : (auteur) La maladie des bandes rouges, d’envergure internationale et causée en France par les deux agents pathogènes du genre Dothistroma, provoque des dégâts sévères dans les houppiers des pins laricio. Le projet Dolar visait à identifier les facteurs pédoclimatiques favorisant l’expression de la maladie des bandes rouges, à étudier la sensibilité à la maladie de matériels d’origines génétiques différentes, et à quantifier l’impact de la maladie des bandes rouges sur la croissance et la production des peuplements en lien avec les scénarios de sylviculture appliqués. Ce travail a été mené principalement dans les régions Centre-Val de Loire et Pays de la Loire. Il s’est appuyé sur des réseaux existants de placettes d’observation et de dispositifs d’expérimentation sylvicole ou génétique, créés et gérés par les différents organismes intervenant dans le projet (CNPF, IGN, INRA, Irstea et ONF). Les principaux résultats obtenus sont les suivants : (1) Les facteurs climatiques, en particulier les variables liées au régime pluviométrique, sont les principaux déterminants de l’expression des dégâts de la maladie des bandes rouges. Au niveau pédologique, seul un léger effet de la richesse trophique a pu être mis en évidence. Ainsi, les précipitations et la fréquence des épisodes pluvieux au printemps augmentent les dégâts, la fréquence des épisodes secs en été les réduit, et les dégâts sont plus sévères dans les stations de faible niveau trophique. (2) Les conjonctions de facteurs stressants ou contraignants pour le pin laricio sont plus favorables à la maladie des bandes rouges. (3) La variabilité de l’intensité des dégâts se trouve essentiellement au niveau de l’individu, quel que soit le domaine étudié : contexte pédoclimatique, gestion sylvicole ou origine génétique. (4) L’intensité des symptômes de la maladie des bandes rouges au niveau de l’arbre est négativement corrélée au statut social de l’arbre au sein du peuplement : les arbres les plus gros sont en moyenne moins affectés. (5) La mortalité causée par la maladie des bandes rouges reste négligeable mais la sévérité des dégâts augmente la probabilité de mortalité des arbres dominés au sein des peuplements de densité élevée. (6) L’accroissement radial des arbres est très lourdement impacté par la maladie, l’intensité des dégâts s’imposant comme le facteur expliquant la plus grande part de variabilité de l’accroissement. En moyenne, l’accroissement individuel est réduit de 50 % pour une intensité de dégâts de 50%. Une sylviculture avec des densités plus faibles permet de maintenir un niveau d’accroissement plus satisfaisant. (7) A l’échelle du peuplement, la maladie des bandes rouges provoquent des pertes de production en surface terrière proportionnelles et équivalentes à la proportion des dégâts, mais la croissance des peuplements reste positive dans la plupart des cas. L’application d’une sylviculture avec des densités plus faibles permet de réduire les pertes d’accroissement, et ce d’autant plus que le niveau de sévérité de la maladie est important. (8) A l’échelle du peuplement, l’intensité des dégâts de la maladie est d’autant plus importante que la densité du peuplement est élevée : une sylviculture en peuplement plus clair permet donc de réduire les dégâts. L’application d’une sylviculture dynamique présente donc le double avantage de réduire et l’intensité de la maladie et les pertes de production (à niveau de maladie constant). (9) Malgré la diversité des matériels génétiques évalués (variété, massif d’origine dans l’aire naturelle, provenance, descendance, clone), l’unité génétique explique peu la variabilité des dégâts observés. Des différences significatives sont mises en évidence, mais également dans certains cas, des interactions entre les effets site et les effets unité génétique. Les différentes analyses menées conduisent parfois à des résultats contradictoires. (10) C’est notamment le cas concernant la variété. Dans les dispositifs génétiques, les deux variétés, Corse et Calabre, se distinguent peu, alors que l’analyse de 17 dispositifs d’expérimentation sylvicole montre que le pin laricio de Calabre est moins atteint par la maladie des bandes rouges que le pin laricio de Corse. L’origine génétique précise des 17 peuplements en question n’est pas connue. Ce résultat est l’illustration de l’importante variabilité existant au sein de chacune des deux variétés de pin laricio. (11) Néanmoins, les Matériels Forestiers de Reproduction (MFR) issus du verger de Pin laricio de Calabre de Sivens sont classés moins sensibles à la maladie des bandes rouges que les MFR produits dans les deux vergers à graines de pin laricio de Corse. L’hybridation des clones composant le verger de Sivens a été génétiquement établie, les clones appartenant à quatre provenances distinctes, une Corse, une Calabre et deux provenances non référencées génétiquement. Les analyses conduites dans le cadre du projet révèlent également que 25% des clones sont des hybrides entre le pin laricio et trois autres sous-espèces de pins noirs. Bien que des analyses complémentaires soient encore envisagées, des recommandations peuvent être formulées à partir des résultats acquis et des enseignements tirés de la littérature internationale. Dans le contexte actuel d’aggravation des épisodes de sécheresse et de risques sanitaires liés à Diplodia pinea, le 2e pathogène foliaire d’importance concernant le pin laricio, et malgré leur sensibilité avérée à la maladie des bandes rouges, nous conseillons de conserver les deux variétés de pin laricio dans le panel des essences de boisement et reboisement utilisables en France. Nous formulons des propositions de gestion sylvicole visant en particulier à réduire l’impact de la maladie sur les peuplements. Les recommandations concernant la gestion des vergers à graines ou plus généralement l’utilisation des Matériels Forestiers de Reproduction visent également à lutter contre l’extension de la maladie ou de son potentiel d’évolution génétique. Numéro de notice : 17353 Affiliation des auteurs : IGN+Ext (2012-2019) Thématique : FORET Nature : Rapport de recherche nature-HAL : RappRech DOI : sans En ligne : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03336070 Format de la ressource électronique : URL Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=98361 Biomass ratio varies along soil water availability : An analysis based on wood density data collected by the French NFI / Baptiste Kerfriden (2019)
Titre : Biomass ratio varies along soil water availability : An analysis based on wood density data collected by the French NFI Type de document : Article/Communication Auteurs : Baptiste Kerfriden Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE Année de publication : 2019 Conférence : Conference 2019, A century of national forest inventories – informing past, present and future decisions 19/05/2019 21/05/2019 Oslo Norvège programme sans actes Langues : Anglais (eng) Descripteur : [Termes IGN] biomasse forestière
[Termes IGN] changement climatique
[Termes IGN] composition d'un peuplement forestier
[Termes IGN] densité du bois
[Termes IGN] humidité du sol
[Termes IGN] inventaire forestier national (données France)
[Vedettes matières IGN] Végétation et changement climatiqueRésumé : (auteur) Biomass ratio is a state variable allowing the conversion of the forest growing stock into biomass (Kauppi et al., 2006). This variable is most often considered constant per tree species despite the huge range of intraspecific variability of basic density. Indeed, the factors that influence wood density are numerous: tree growth and age, competition (e.g. forest structure), genetics as well as intra and inter annual climatic variations. In light of such diversity, scientific research into forest biomass characteristics is required to better incorporate the heterogeneity of forests in the forest carbon accounting methods (Bowen et al., 2011).
Materials and methods: In 2016 and 2017 over fifty five thousands increment cores were collected in the field by the French NFI. Wood density measurements were performed at INRA (Leban et al., 2019, this conference) and combined with the French NFI calculation system, biomass ratio can now be computed as a standard. This quantity can now be depicted over stratification variables such as soil water availability. An exploratory and ANOVA-assisted analysis of this gradient was performed.
Results: Biomass ratio was found strongly related to soil water availability, with a decrease of biomass ratio at the hardwood and softwood scale, but no correlation were found at the specie level. Explanations come from the species repartition along the gradients from high wood density to low density driven by soil water availability.
Conclusion: Wood density data acquired on the French NFI allow major steps forward toward the proper estimate of forest biomass resources and of carbon sequestration. Biomass ratio was found correlated with climatic contexts, suggesting that biomass sequestration at constant volume may increase in a warmer climate. But this change will be made through change of composition of the forest rather than an adaptation of the species.Numéro de notice : C2019-049 Affiliation des auteurs : LIF+Ext (2012-2019) Thématique : FORET Nature : Poster nature-HAL : Poster-avec-CL DOI : sans Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=95768
Titre : DIDRO, un outil intégré pour l'auscultation des digues par drone Type de document : Article/Communication Auteurs : D. Boggio, Auteur ; J.L. Sorin, Auteur ; Marc Pierrot-Deseilligny Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE Année de publication : 2019 Projets : 1-Pas de projet / Conférence : Digues 2019, 3ème Colloque sur les digues maritimes et fluviales de protection contre les inondations 20/03/2019 21/03/2019 Aix-en-Provence France Open Access Proceedings Importance : 6 p. Format : 21 x 30 cm Note générale : bibliographie Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Photogrammétrie numérique
[Termes IGN] acquisition d'images
[Termes IGN] auscultation d'ouvrage
[Termes IGN] chaîne de production
[Termes IGN] digue
[Termes IGN] image captée par drone
[Termes IGN] risque technologiqueRésumé : (auteur) L'usage des drones se démocratise, ouvrant pour les gestionnaires de digues des perspectives de reconnaissance et d'auscultation de leurs ouvrages par voie aérienne à des coûts d'opération raisonnables. L'instrumentation de mesure se miniaturise, son coût diminue, et permet une vision globale et profonde des infrastructures, souvent au-delà de ce que peut détecter l'humain, ou avant que les conséquences d'une anomalie majeure ne soient visibles à l'oeil nu. DIDRO est un consortium de chercheurs et d'industriels, réunis sous l'impulsion d'opérateurs de drones et de gestionnaires de digues. Trois ans de travaux ont permis de mettre au point des techniques d'acquisition d'image et d'interprétation des résultats pour l'aide à la détection de désordres sur les ouvrages. Cette communication présente le dispositif d'acquisition de données par drones et les outils d'aide à la décision issus d'une acquisition de données par drones. Deux drones volants à usage professionnel sont évalués et leurs caractéristiques comparées, afin d'en dresser les conditions d'utilisation et le type d'équipement qu'ils peuvent embarquer. Des capteurs adaptés à l'auscultation des digues sont également présentés. Les phénomènes qu'ils permettent de mettre en évidence sont décrits, ainsi que les protocoles d'acquisition de mesures et d'analyse des données recueillies. L'outil drone équipé, associé à une plateforme numérique d'analyse de données métier, est un allié précieux du gestionnaire de digues dans la collecte d'informations concordantes à grande échelle, lui permettant de cibler les zones sensibles de l'ouvrage. Numéro de notice : C2019-052 Affiliation des auteurs : LASTIG MATIS+Ext (2012-2019) Autre URL associée : vers HAL Thématique : IMAGERIE Nature : Communication nature-HAL : ComAvecCL&ActesPubliésNat DOI : 10.5281/zenodo.2530658 En ligne : https://digues2019.inrae.fr/wp-content/uploads/2019/11/47_DIDRO_Digues_2019.pdf Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96548
Titre : This is my spot: characteristics of trees bearing Black Woodpecker cavities Type de document : Article/Communication Auteurs : Camille Puverel, Auteur ; Anick Abourachid, Auteur ; Christine Böhmer, Auteur ; B. Kerfiden, Auteur ; Jean-Michel Leban Editeur : Paris [France] : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement INRAE Année de publication : 2019 Conférence : Woodpecker 2019, 8th International Woodpecker Conference 16/03/2019 19/03/2019 Białowieża Pologne Open Access Proceedings Langues : Français (fre) Descripteur : [Vedettes matières IGN] Ecologie
[Termes IGN] arbre (flore)
[Termes IGN] Aves
[Termes IGN] habitat (nature)
[Termes IGN] politique de conservation (biodiversité)Numéro de notice : C2019-053 Affiliation des auteurs : LIF+Ext (2012-2019) Thématique : BIODIVERSITE/FORET Nature : Poster nature-HAL : Poster-avec-CL En ligne : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02609899 Format de la ressource électronique : URL article Permalink : https://documentation.ensg.eu/index.php?lvl=notice_display&id=96553 PermalinkPermalinkPermalinkPermalink
